RESPONSABILITÉS :
Présentation de l'unité :
L'unité ISTCT est une unité mixte de recherche du CNRS et de l'Université de Caen-Normandie (UNICAEN) hébergée au GIP CYCERON.
Les activités de recherche d'ISTCT visent à mieux comprendre la physiopathologie des tumeurs hypoxiques (cerveau-poumon) et identifier de nouvelles stratégies thérapeutiques ciblant la tumeur et son microenvironnement mais aussi à protéger le tissu sain environnant des traitements anti-cancéreux tels que la radiothérapie.
Positionnement hiérarchique :
Sous la responsabilité du Dr Aurélien JUSTET, MCU-PH (n+1) et la direction unité (Dir. Myriam BERNAUDIN, Dir Adj. Samuel VALABLE).
Missions :
Dans le cadre des activités de recherche du projet SOMAFIBRAD porté par A. JUSTET au sein de l‘unité ISTCT, le/la bioinformaticien(ne) participera à un projet visant à analyser et intégrer des données transcriptomique et génomique en vue d'identifier les mutations somatiques associées à l'existences de populations cellulaires impliquées dqns la fibrogenèse pulmonaire.
Activités principales du poste :
• Définition et mise en oeuvre le protocole d'analyse de données biologiques : traitement, nettoyage et normalisation de données issues d'ananlyse transcriptomique à noyaux unique
• Identification de mutations somatiques à partir du pipeline GATK mise en place par le broadInstitute
• Développement de pipelines reproductibles : création et maintenance de workflows d'analyse sous R/Python
• Interaction avec l'équipe-projet : échanges réguliers avec biologistes, cliniciens et biostatisticiens ; participation aux réunions de projet et des collaborateurs internationaux (Yale University,Univeriste d' Hannovre)
• Diffusion et valorisation des résultats et réalisations technologiques sous forme de communication scientifique et préparation de figures, rapports, documentation, contributions aux publications.
• Gestion des données : organisation, documentation et archivage des données selon les bonnes pratiques en recherche (PGD, FAIR, traçabilité).
• Veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité
• Formation, en interne (ex Doctorants, post-doctorants) et en externe, aux principes et à la mise en œuvre des techniques citées précédemment.
Conditions particulières d'exercice :
• Télétravail possible (avec un maximum de 2 jours par semaine et selon les contraintes du projet/service)
• Nécessité d'adaptation aux contraintes de service et d'horaires
• L'agent sera amené à accompagner et former les nouveaux arrivants dans l'unité à la culture cellulaire.
PROFIL RECHERCHÉ :
Catégorie d'emploi : A
Diplôme requis :
Diplôme d'ingénieur, Doctorat
Formation solide en bioinformatique, biostatistiques, data science ou équivalent
Compétences attendues:
Connaissances :
• Bioinformatique, biostatistiques, analyse de données omiques.
• Connaissances solides en R et/ou Python (ou autre langage de programmation)
• Notions avancées en cytométrie en flux ou en protéomique (au moins l'un des deux ; idéalement les deux).
• Connaissances en méthodes d'intégration de données multi-omics.
• Compréhension générale de la biologie des systèmes, immunologie ou cancérologie (apprécié).
• Connaissance des principes FAIR et des bonnes pratiques de gestion des données.
Compétences opérationnelles :
• Concevoir, traiter et analyser des données multiparamétriques volumineuses
• Construire et documenter des pipelines d'analyse reproductibles
• Mettre en œuvre des analyses statistiques avancées
• Visualiser et présenter clairement des résultats complexes
• Rédiger des méthodologies, des rapports et des documents techniques
• Travailler en équipe
Compétences comportementales :
• Rigueur scientifique
• Capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire
• Autonomie dans la gestion des projets d'analyse
• Esprit analytique, capacités de synthèse
• Qualités relationnelles
• Organisation et gestion de projets
• Capacité d'adaptation
• Capacité à anticiper et résoudre les problèmes
• Bonnes compétences de communication orale et écrite
Conditions de recrutement :
Recrutement sur contrat de recherche, sous réserve de la disponibilité du financement.
Poste à temps complet, ouvert uniquement aux contractuels (CDD).
Rémunération statutaire et appréciée en fonction de l'expérience professionnelle.
A compétences égales, priorité aux travailleurs handicapés et aux autres bénéficiaires de l'obligation d'emploi.
Poste à pourvoir : 1er avril 2026 au 30 juin 2027, renouvelable.
Date limite de candidature : 01/03/2026
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