Mission :
Ingénieur de recherche (28 mois) participant à la réalisation d'un projet collaboratif en onco-immunologie sur des tumeurs d'une cohorte de patients atteints de carcinomes épidermoïdes de la tête et du cou. Assurer l'organisation et l'exécution expérimentale du projet en collaboration avec les plateformes technologiques (Imagerie par cytométrie de masse, transcriptomique spatiale). Ces études utiliseront des données scRNAseq et d'imagerie multidimensionnelle (proteines/ARN). Le candidat participera à la conception de panels d'analyses multiparamétriques. Il utilisera/développera des méthodes informatiques pour l'analyse spatiale des images en étroite interaction avec les membres de l'équipe et le réseau de collaborateurs scientifiques et cliniques du projet.
Activités :
- Participer à la conception de panels de marquages en imagerie multiparamétrique (imagerie par cytométrie de masse, immunofluorescence)
- Participer à la conception d'un panel de transcriptomique spatiale
- Coordonner le transfert des échantillons biologiques entre partenaires
- Gérer les données d'imagerie haute dimension générées (IMC, transcriptomique spatiale)
- Appliquer des méthodes informatiques pour l'analyse spatiale de marquages de coupes de tumeurs humaines
- Développer des méthodes informatiques pour l'analyse spatiale de marquages multiparamétriques de coupes de tumeurs humaines
- Assurer la mise en forme des résultats et la présentation des résultats
- Rédiger des rapports
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