Chercheur en chimie analytique protéomique (h/f)

Vos missions en quelques mots Missions : Le candidat (H/F) développera de nouvelles méthodes analytiques pour l’analyse protéomique spatiale avec un niveau de granularité allant jusqu’à la cellule unique. Il/elle développera des méthodes de préparation des échantillons par microdissection laser couplée à un système de micro fluidique et des systèmes nanoLC-MS/MS de pointe ultra-sensibles et ultra-rapides. Activités : - Développer des méthodes de préparation d’échantillons ciblées par microdissection laser jusqu’à la cellule unique et les coupler avec une robotique microfluidique; - Développer des méthodes d’acquisition nanoLC-MS/MS ultra-rapides et sensibles pour l’analyse du protéome de cellules uniques sur des couplages nanoLC-MS/MS de dernière génération de type Q-TOF (TimsTOF AIP de Bruker) et Orbitrap-Astral (Thermo); - Mettre au point un système de nano-chromatographie innovant plus sensible et permettant un débit d’analyses plus élevé (jusqu’à 140 échantillons/jour); - Développer des stratégies d’interprétation bioinformatique et biostatistique des données de protéomique sur cellule unique basées sur des approches d’apprentissage automatique et d’intelligence artificielle; - Publier et valoriser les résultats Contexte de travail : L’Institut Pluridisciplinaire Hubert CURIEN (IPHC), unité mixte de recherche sous cotutelle du CNRS et de l’Université de Strasbourg (UMR7178), est un laboratoire pluridisciplinaire où des équipes de recherche de cultures scientifiques différentes (écologie, physiologie et éthologie, chimie et physique subatomique) développent des programmes de très haut niveau avec pour socle l’instrumentation scientifique. L'IPHC est structuré en 3 départements et comptabilise un effectif total de plus de 400 agents. Le candidat (H/F) rejoindra l'équipe LSMBO (Laboratoire de Spectrométrie de Masse BioOrganique) de l'IPHC, où il bénéficiera de l’ensemble du parc instrumental de pointe (LC-MS/MS) pour l’analyse protéomique. Le projet sera mené en collaboration avec l’équipe « Dynamique Membranaire & Virus » dirigée par le Dr. R. Gaudin (IRIM, Montpellier), l’équipe du Dr. JC. Olivo-Marin (Institut Pasteur, Paris) et les sites toulousain et grenoblois de l’infrastructure nationale de protéomique ProFI (UAR2048). Le candidat (H/F) bénéficiera de l'accès à un restaurant administratif, d'une prise en charge partielle des titres de transport, d'un comité d'entreprise, la possibilité de télétravail d’une à deux journées pour une partie des activités sous réserve de l’accord du responsable de l’équipe et de formations pour l'adaptation au poste de travail. Profil recherché Competences : Savoirs généraux, théoriques ou disciplinaires - Expertise en chimie bioanalytique, spectrométrie de masse et analyse protéomique requises. Maîtrise des outils de traitement bioinformatique des données MS/MS. Savoir-faire opérationnels - Expertise en analyse protéomique à haut débit, en particulier pour l’analyse ultra-sensible; - Expertise en techniques de chromatographie liquide (chromatographie sur phase inverse) et de spectrométrie de masse en tandem; - Maîtrise des outils informatiques de traitement des données LC-MS/MS, incluant les stratégies d’apprentissage automatique et d’intelligence artificielle; - Maîtrise des systèmes microfluidiques et de tri cellulaire - Gestion du travail dans un environnement certifié ISO9001; - Communication et échanges scientifiques avec les collaborateurs du projet; - Travail en équipe et en collaboration dans un contexte pluridisciplinaire innovant; - Maîtrise de l'anglais écrit et oral de niveau B2 selon le cadre européen commun de référence pour les langues pour la présentation des résultats lors de congrès et la rédaction de publications. Contraintes et risques : Travail dans un environnement certifié ISO 9001 Niveau d'études minimum requis Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents Spécialisation Formations générales Langues Français Seuil