Mission :
L'ingénieur de recherche, spécialisé en approches biologie et analyses de laboratoire aura comme missions d'assurer des mesures à haut débit de la biodiversté pélagique microbienne marine en Manche Orientale et Mer du Nord dans le cadre, incluant le travail de terrain, de laboratoire, traitement des données brutes et analyse de données en vue de leur rapportage et publication,
Activités :
- Développer des protocoles standardisés pour l'utilisation en routine des instruments de pointes mise en place au sein des plateformes technologiques dont celles acquises sur les grands projets structurant comme le CPER IDEAL (Next-Generation Sequencing, Expérimentale et Observation, Géomatique et Télédétection)
- Apporter un soutien technique et théorique sur les aspects de biologie moléculaire et biologie cellulaire nécessaires à la bonne réalisation expérimentale d'un projet scientifique
- Conseiller et apporter des solutions techniques pour permettre de lever les verrous méthodologiques en analyses moléculaires de diversité taxonomique, fonctionnelle et activités microbiennes.
- Analyser les échantillons (extraction d'acides nucléiques, clonage/séquençage, préparation de librairie d'ADN, séquençage, analyses automatisées…) dans le cadre des projets scientifiques, de suivi des écosystèmes et/ou de prestations de service
- Mettre en place et utiliser des outils bio-informatiques pour l'analyser, l'interprétation et la validation des résultats
- Assurer une veille scientifique pour faire évoluer les pratiques et les protocoles selon les dernières normes et développements technologiques
- Participer ponctuellement à des campagnes de terrain (prélèvements et mesures in situ...)
- Gérer le planning d'utilisation des appareils et veiller à l'application des règles d'hygiène et de sécurité
- Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques via des publications, des protocoles et des rapports techniques
- Former, en interne et en externe, aux technologies de pointe (notamment en microbiologie, biologie moléculaire, séquençage à haut débit) et encadrer les utilisateurs
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