Doctorant /doctorante (h/f) en physique de la matière complexe et vivante

Informations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR7325-VALSEV-160 Date de début de diffusion 21/05/2026 Date de parution 22/05/2026 Date de fin de diffusion 11/06/2026 Intitulé long de l'offre doctorant /doctorante (H/F) en physique de la matière complexe et vivante Date limite de candidature 11/06/2026 Nature du contrat CDD de 3 ans Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Chercheuse / Chercheur Statut du poste Vacant Intitulé du poste doctorant /doctorante (H/F) en physique de la matière complexe et vivante Descriptif de l'employeur Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique. Description du poste Sujet de thèse : Titre : Inférence de la dynamique stochastique dans les systèmes biologiques actifs en développement Les tissus vivants, les cellules migratrices ou les particules actives constituent des systèmes hors d'équilibre dans lesquels les forces internes, les interactions collectives et la géométrie de l'environnement façonnent des dynamiques complexes. Leur description quantitative requiert des méthodes capables d'extraire, à partir de trajectoires bruitées et partiellement observées, les forces effectives, les interactions, les lois du mouvement, ainsi que l'influence de variables cachées ou de bruits non blancs. Ce projet de thèse vise à développer et appliquer une nouvelle génération de méthodes d'inférence de la dynamique stochastique, à la croisée de la physique statistique, de la biophysique et de l'apprentissage automatique. Ces approches s'appuieront sur des outils récemment introduits dans le groupe, en particulier : • des méthodes non linéaires d'inférence paramétrique et non paramétrique ; • l'augmentation de variables latentes couplée à des schémas EM pour améliorer l'identifiabilité ; • l'extension du formalisme aux systèmes dynamiques soumis à un bruit coloré (mémoire, sous-diffusion, corrélations temporelles), particulièrement pertinent pour les systèmes biologiques actifs. Plan scientifique indicatif 1. Développement méthodologique ◦ Extension des méthodes d'inférence non linéaires (paramétriques et non paramétriques). ◦ Intégration d'un schéma EM avec augmentation de variables pour traiter les variables cachées et les biais d'identifiabilité. 2. Validation sur des systèmes modèles ◦ Simulations contrôlées (EDS non linéaires, modèles actifs, dynamiques à mémoire). ◦ Étude de la robustesse des méthodes (bruit, faible fréquence d'échantillonnage, observabilité partielle). 3. Application à des données biologiques ◦ Analyse de trajectoires dans des tissus en développement (ex. : embryon de Drosophile, épithélium cilié, systèmes multicellulaires). ◦ Reconstruction des interactions effectives, des champs de force et des contributions actives. ◦ Interprétation biophysique en collaboration avec des partenaires expérimentaux. Contexte : La personne recrutée rejoindra un groupe actif en biophysique théorique et en inférence computationnelle (groupe SuperStoc, ERC), avec des liens étroits vers des collaborations expérimentales au sein du Turing Centre for Living Systems (Centuri, Aix-Marseille Université). La thèse combinera développement théorique, analyse de données réelles et interaction avec des applications biologiques. Le projet offre un cadre propice à des contributions originales, tant conceptuelles que méthodologiques. L'environnement de travail est international et pluridisciplinaire.La personne recrutée bénéficiera d'un encadrement régulier, et participera à des écoles d'été et conférences nationales et internationales. Conditions particulières d'exercice Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche. Descriptif du profil recherché Contraintes et risques : Travail sur écran. Aucune contrainte physique ou risque particulier. Temps plein Oui Rémunération contractuels (en € brut/an) La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel Localisation du poste Europe, France, Provence-Alpes-Côte-D'Azur, Bouches du Rhône (13) Géolocalisation du poste MARSEILLE 09 Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 13288 MARSEILLE 09 (France) Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 7 Master/diplômes équivalents Spécialisation Formations générales Langues Français (Seuil)