Informations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR5077-MARPEL1-021 Date de début de diffusion 28/04/2026 Date de parution 04/05/2026 Date de fin de diffusion 19/05/2026 Intitulé long de l'offre Doctorant en Biologie des systèmes computationnelle / Bio-informatique (H/F) Date limite de candidature 19/05/2026 Nature du contrat CDD de 3 ans Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Chercheuse / Chercheur Statut du poste Vacant Intitulé du poste Doctorant en Biologie des systèmes computationnelle / Bio-informatique (H/F) Descriptif de l'employeur Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique. Description du poste Sujet de thèse : Le projet DigiTREAT est financé dans le cadre du programme PEPR Santé numérique (France 2030 – ANR) afin de développer le premier jumeau numérique médical multi-échelle dédié à la polyarthrite rhumatoïde (RA-DT). Le projet est coordonné par le professeur Anna Niarakis au Centre de Biologie. Le/La doctorant(e) travaillera sur la construction et le calibrage d'un modèle générique multi-échelle intégrant des données omiques accessibles au public. Pour cela, il/elle devra : - Analyser et intégrer des ensembles de données omiques issues de cellules individuelles et de populations. - Développer des modèles computationnels prédictifs. - Étalonner et valider des modèles computationnels à l'aide de données expérimentales. - Améliorer des performances prédictives et de la précision biologique. - Contribuer à la découverte de biomarqueurs. La personne recrutée devra être titulaire d'un Master Bio-Informatique, Biologie Computationnelle ou dans un domaine connexe. Le projet requiert une expérience avec les données omiques (scRNA-seq et/ou bulk), des compétences en programmation : R, Python (la maîtrise de C++ est un atout), de solides compétences analytiques et interdisciplinaires, ainsi que la maîtrise de l'anglais. Contexte : Le projet DigiTREAT, financé par le programme PEPR Digital Health, vise à développer un jumeau numérique multi-échelle pour la polyarthrite rhumatoïde (PR) en intégrant la modélisation computationnelle, les données omiques et les cohortes cliniques. Le projet répond à un besoin clinique majeur non satisfait : prédire la réponse au traitement dans les maladies auto-immunes complexes. Le poste est basé au Centre de Biologie Intégrative (CBI) de Toulouse, un centre de recherche commun au CNRS et à l'Université Toulouse III – Paul Sabatier dédié à la biologie intégrative à toutes les échelles. Le candidat rejoindra la division de biologie des systèmes et sera supervisé par le professeur Anna Niarakis. https://cbi-toulouse.fr/en/equipe/pole-de-biologie-des-systemes-en/ Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR. Conditions particulières d'exercice Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche. Descriptif du profil recherché Contraintes et risques : Temps plein Oui Rémunération contractuels (en € brut/an) La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel Localisation du poste Europe, France, Occitanie, Haute Garonne (31) Géolocalisation du poste TOULOUSE Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 31062 TOULOUSE (France) Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents Spécialisation Formations générales Langues Français (Seuil)
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