Ingénieur-e biologiste en plateforme scientifique h/f

Informations générales

Réservé aux agents CNRS (fonctionnaires et CDI) et aux fonctionnaires et CDI de droit public
Intitulé de l'offre : Ingénieur-e biologiste en plateforme scientifique H/F
Référence : UPR2357-MOBINT-O53009
Lieu de travail : STRASBOURG
Institut : INSB - Institut des sciences biologiques
Date de publication : mardi 29 avril 2025
Session : Campagne Printemps 2025
Groupe de Fonction : IRG3
BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en plateforme scientifique

Missions

L'ingénieur(e) aura pour missions de concevoir, développer, adapter et expérimenter de nouvelles
méthodologies en chromatographie et spectrométrie de masse et analyse métabolomique des plantes avec
les équipes de recherche de l'unité.
Il/elle devra contribuer aux travaux de recherche d'une équipe dont l'axe de recherche est le
métabolisme spécialisé des plantes pour 50% de la quotité.

Activités

- Déterminer un ensemble cohérent de techniques de métabolomique nécessaires à la réalisation
expérimentale de projets scientifiques,
- Concevoir le développement et conduire en spécialiste, en collaboration avec les équipes de
recherche, la réalisation de projets de métabolomique ciblée et non ciblée, sur différentes espèces
végétales,
- Évaluer et mobiliser les ressources analytiques nécessaires aux expérimentations en relation avec
le montage et le développement des projets des équipes/utilisateurs de la plateforme,
- Conseiller, évaluer et valider les options techniques d'un projet scientifique,
- Expérimenter de nouvelles technologies et établir des protocoles inédits en contrefort des projets
proposés par les équipes,
- Conseiller en expert les utilisateurs sur l'interprétation et l'exploitation des données, valider
et interpréter les résultats issus de la réalisation expérimentale de projets scientifiques,
- Proposer de nouvelles pistes en relation avec les résultats obtenus et les connaissances du
domaine,
- Assurer une veille scientifique, technologique et bibliographique,
- Répertorier et gérer les stocks attenants aux instruments et matériels utilisés,
- Former et encadrer le personnel à l'utilisation des instruments et logiciels d'acquisition et de
traitement des données, en particulier les étudiants et chercheurs participants aux projet de
recherche,
- Diffuser et valoriser les résultats obtenus sous forme d'articles de recherche ou lors de
séminaires (pour diffuser les compétences analytiques de la plateforme notamment),
- Participer à la rédaction de dossiers dans le cadre de demandes de financements pour l'IBMP.
- Gérer les moyens humains et techniques alloués à la plateforme en relation avec le comité de
pilotage de la plateforme, qui a la responsabilité de la plateforme,
- Appliquer et faire appliquer les règles d'hygiène et de sécurité.

Compétences

Savoirs:
- Connaissances approfondies dans le domaine d'expertise : chromatographie LC et GC; spectrométrie
de masse; chimie analytique; analyse et traitement de données,
-Très bon niveau bibliographique dans le domaine de la métabolomique,
-Règlementation en matière d'hygiène et de sécurité,
-Cadre légal et déontologique,
-Langue anglaise : B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues).
Savoir-faire :
- Expertise dans une ou plusieurs de ces méthodes :
.Profilage semi-ciblé par GC-FID / GC-MS et LC-UV / LC-MS d'acides gras et de leurs dérivés oxydés,
de triterpènes, de stérols, de terpénoïdes et de dérivés phénoliques,
.Profilage ciblé par LC-MS d'hormones végétales, par LC-MS de métabolites primaires, par LC-MS de
nucléotides modifiés,
.Analyse métabolomique (non-ciblée) par GC-MS,
.Analyse métabolomique (non-ciblée) par LC-MS haute résolution.
- Expertise dans l'analyse computationnelle de données métabolomiques (processing, annotation
analyse statistique :
.Maîtrise des logiciels et pipelines d'analyse courants (Mass Hunter, MZmine, GNPS workflow, Sirius,
,
.Connaissances dans l'interprétation de données spectrales et bases de données (NIST, Wiley,
LipidMaps, SwissLipids, LipidBlast, KNApSAcK, GNPS, Sirius,
.Rigueur dans la documentation et l'archivage des méthodes, données brutes et métadata
expérimentales selon les standards FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable),
- Rédiger des documents scientifiques, articles ou demandes de financement.
Savoir être :
Être rigoureux,
Faire preuve d'autonomie,
Capacité à travailler en équipe,
Qualités relationnelles.
Compétences managériales :
Savoir encadrer des étudiants de niveau master ou doctorat,
Avoir des capacités d'analyse et de prise de décision, savoir planifier et déléguer,
Gérer les relations avec des interlocuteurs, avec les instances de pilotage de l'unité.
Faire preuve d'intelligence émotionnelle.

Contexte de travail

L'ingénieur-e travaillera à l'Institut de biologie moléculaire des plantes du CNRS (IBMP), la seule
unité propre de recherche du CNRS entièrement dédiée à la biologie végétale. L'IBMP est associé à
l'Université de Strasbourg, localisé sur le campus Esplanade. Cette unité est constituée de 19
équipes de recherche et d'environ 180 chercheurs, enseignant-chercheurs, personnels techniques et
contractuels. L'activité de recherche de l'Institut est dédiée à l'étude des mécanismes fondamentaux
de la vie des plantes. L'unité d'accueil s'attache à déchiffrer les processus de régulation de
l'expression des gènes, à étudier le développement et la croissance des plantes, comprendre comment
ces dernières s'adaptent à leur environnement, découvrir comment virus ou bactéries interagissent
avec le monde végétal. En particulier, l'unité d'accueil utilise des approches multidisciplinaires
de la chimie analytique à la génétique pour élucider le métabolisme des plantes et sa diversité, les
voies de biosynthèse de métabolites et signaux chimiques, leur régulation et évolution, et les
fonctions biologiques de ces métabolites.
L'ingénieur-e, sera affecté à 50% dans la plateforme de métabolomique de l'IBMP et à 50% dans une
équipe de recherche.
L'IBMP est facilement accessible en transport en commun et bénéficie d'un restaurant administratif
qui est situé à proximité de l'unité.