Issue d'un projet Idex associant l'Unité Epigénétique et Destin Cellulaire (EDC), l'Institut Jacques Monod
(IJM), l'Institut Cochin, et la plateforme Ressource Parisienne en Bioinformatique Structurale (RPBS,
hébergée au sein de l'Unité Biologie Fonctionnelle et Adaptative, BFA), la plateforme iPOP-UP est dédiée
à la recherche en biologie intégrative. Elle s'inscrit également dans un réseau collaboratif visant à
fédérer les expertises entre laboratoires et instituts, renforçant ainsi les synergies scientifiques.
La mission principale d'iPOP-UP est de soutenir les équipes de recherche dans la gestion et l'analyse
des données complexes issues des approches omiques (génomique, transcriptomique, protéomique,
etc.) et de la biologie structurale. Cette plateforme permet en effet aux biologistes comme aux
bioinformaticiens, quel que soit leur niveau en bioinformatique, de réaliser des analyses pertinentes
pour leurs projets de recherche. RÉSUMÉ DU POSTE
- Conseiller, lors de la construction d'un projet, sur les méthodes et outils pertinents lors de
l'élaboration d'un pipeline complet de séquençage et analyse de résultats.
- Accompagner le traitement et l'exploitation des données, mise en place ou adaptation de pipelines
pour leur analyse et interprétation, tout en assurant le débo-gage des scripts en cas d'arrêt d'exécution
sur le cluster.
- Contribuer à la valorisation des résultats à travers des outils visuels, des rapports analy-tiques ou
des publications.
- Accompagner la gestion du cycle de vie des données du calcul, leur organisation, leur suivi et leur
exploitation jusqu'à la visualisation
- Assurer le transfert de connaissances et des savoir- faire par la participation aux réunions bioinformatiques, la conduite de formations et l'accompagnement de scientifiques
Ce poste implique un rôle clé dans l'accompagnement des équipes pour les rendre autonomes tout en
répondant aux besoins techniques et scientifiques des projets.
DESCRIPTIF DES ACTIVITÉS
1) Accompagnement et conseil scientifique
- Soutenir les équipes de biologie du site des Grands Moulins (BFA, EDC, IJM) dans la définition des
analyses nécessaires pour répondre à leurs questions biologiques, depuis la conception des projets
jusqu'à la valorisation des résultats.
- Fournir des recommandations sur les techniques de séquençage (type, profondeur, para-mètres) et
les stratégies analytiques adaptées, en favorisant une approche collaborative et l'autonomie des
équipes.
- Aider les utilisateurs à comprendre et exploiter efficacement les outils bioinformatiques
disponibles pour leurs analyses.
2) Support technique collaboratif
- Accompagner les utilisateurs dans la résolution des difficultés techniques en bioinforma-tique, tout
en leur apportant les outils nécessaires pour gagner en autonomie.
- Accompagner les utilisateurs dans l'utilisation du cluster et les assister pour résoudre les
problèmes rencontrés.
- Prendre en charge, si nécessaire, des étapes spécifiques d'analyses complexes, tout en trans-férant
les compétences pour pérenniser l'expertise au sein des équipes.
3) Formation et transfert de compétences
- Former les membres des équipes à l'utilisation des outils bioinformatiques et à l'interprétation des
résultats, en favorisant leur montée en compétences.
- En coordination avec les autres intervenants d'iPOP-UP, proposer des sessions de formation ou des
ateliers pour renforcer l'autonomie des équipes sur des outils ou méthodes spéci-fiques.
- Participer à la formation et aux conseils à l'utilisation du cluster et sa documentation.
4) Conception et diffusion méthodologique
- Mettre en place et adapter des pipelines bioinformatiques en collaboration avec les cher-cheurs, en
s'assurant de leur appropriation par les équipes.
- Documenter des outils et pipelines pour l'analyse des données omiques, à plus long terme
possibilité d'aider au développement d'outils innovants.
- Garan
En cliquant sur "JE DÉPOSE MON CV", vous acceptez nos CGU et déclarez avoir pris connaissance de la politique de protection des données du site jobijoba.com.