Rattaché(e) au Chef d'Équipe de Bio-Informatique Clinique, votre activitéconsisteà/au :
* Implémentation de pipelines d'analyses pour le Pôle de Médecine diagnostique et théranostique (notamment pour la génétique, l'immunologie clinique, la pharmacologie et la pathologie numérique)
* Développement d'outils spécifiques au diagnostic clinique
* Calibration et validation des pipelines d'analyses
* Aide à l'interprétation fonctionnelle des résultats à l'aide de solutions internes (bases de connaissance) et de bases de données externes.
* Contribuer à l'évolution et la maintenance des pipelines diagnostiques : Mises à jour, bug reporting, validations
* Participer à l'analyse de projets de recherche associés à des essais cliniques
* Présentation régulière des avancées aux biologistes, présentation des travaux lors de séminaires
* Veille technologique et Expertise des solutions répondant aux demandes des biologistes (tests d'outils / tests des paramètres pour être adapté aux besoins du diagnostic)
* Participation aux groupes de travail nationaux
Profil recherché
Compétences requises :
* Maîtriser l'environnement linux
* Maîtriser au moins l'un des langages de programmation suivants (idéalement avoir de l'expérience sur plusieurs d'entre eux) : python, java, c, c++, R ou autre langage orienté objet
* Bonnes connaissances en algorithmique
* Bonnes connaissances des outils standards de bioinformatique pour l'analyse et l'interprétation des données de séquençage haut-débit (DNA et RNAseq)
* Avoir un attrait pour les interactions avec les biologistes
* Maîtrise de l'anglais technique et scientifique à l'oral et à l'écrit
* Rigueur, dynamisme, capacité à travailler en autonomie
* Excellent esprit d'équipe
* Des compétences dans l'un ou plusieurs domaines suivants seraient un gros plus : utilisation de cluster de calcul (SGE / SLURM / LSF /
MOAB, etc.), expérience en calcul distribué, utilisation de GPU, expérience en machine learning / deep learning
* Des connaissances en immunologie et en oncologie sont un plus
L'Institut Curie est un employeur inclusif respectant l'égalité des chances.
Nos opportunités sont ouvertes à des personnes en situation de handicap.
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