Bioinformaticien de recherche niveau 4 / data manager

Mission

Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine est à un stade de maturité, qui lui a permis, grâce à la recherche d’excellence qui s’y réalise à travers la programmation scientifique de haut niveau dans ses créneaux mère-enfant, de recevoir au cours de la dernière année, des dons majeurs qui seront transformationnels et ouvriront d’innombrables perspectives pour la recherche en santé des enfants. Le Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine réunit une équipe de plus de 1200 personnes, soit plus de 295 chercheuses et chercheurs, dont plus de 160 en recherche clinique et plus de 580 étudiantes et étudiants aux cycles supérieurs et stagiaires de recherche postdoctorale œuvrant dans des domaines d’expertise multiples. Travaillant étroitement avec les équipes de soins du CHU Sainte-Justine, cette communauté se dévoue à la recherche fondamentale, clinique et translationnelle au sein de six axes de recherche.

Projet

Laboratoire de recherche du .

Sous la responsabilité du directeur du Dr S. Jacquemont, le bioinformaticien/data-manager devra identifier, annoter et analyser des variants génétique à partir de données de génotypage et de séquençage (exome et génome complet). Le projet explore l’impact de variants génétiques sur la cognition, le comportement et les traits psychiatriques et neurodéveloppementaux. Il devra également superviser le travail des autres bioinformaticiens du laboratoire et de tous les étudiants qui travaillent sur les données disponibles sur les serveurs. Il sera responsable de l’organisation des données, de l'optimisation des protocoles d’analyse et des pipelines développés au laboratoire en collaboration avec les autres membres de l’équipe.

Des responsabilités supplémentaires consistent en la gestion des actifs informationnels (applications web et serveurs) de l'équipe, la rédaction de documentation, l'assurance-qualité et l'écriture des tests automatisés, et la maintenance du code. Une volonté de travailler en étroite collaboration avec les membres de l’équipe ainsi qu’avec nos collaborateurs est indispensable. Le candidat doit apprendre rapidement et volontairement, avoir un excellent sens de l'organisation, être capable de travailler de manière indépendante et de communiquer de façon efficace oralement et par écrit.

Tes défis

1. Identification, annotation, analyse de variants génomiques structurels. Les data à analyser comprennent des données de génotypage sur 800000 individus et des données de séquençage (exome et génome complet) sur environ 150 000 individus;
2. Supervision d’étudiants travaillant sur les données générées (accès, partage et respect des bonnes procédures);
3. Gestion et coordination du travail en bio-informatique du laboratoire;
4. Développement et rédaction des procédures de traitement des données dans le laboratoire;
5. Organisation et hiérarchisation des données sur les serveurs (Compute Canada);
6. Concevoir, optimiser et automatiser des pipelines d’analyse sur des infrastructures locales et cloud (AWS, Google Cloud);
7. Documentation et communication sur le processus d’analyse, résultats, outils et techniques utilisés;
8. Interaction avec les membres du laboratoire afin d’élaborer des stratégies d’analyses.

Profil

Tes acquis et talents

9. Niveau d’études : PhD en bioinformatique, en génomique ou en informatique avec

10. Bonne connaissance des langages de programmation suivants : Bash, Python, R, Hail, Spark, etc. ;
11. Bonne maîtrise des infrastructures cloud (AWS, Google Cloud) ;
12. Une certaine expérience avec les bases de données relationnelles (MySQL, PostgreSQL, ElasticSearch).
13. Connaissance des méthodes statistiques de base et du langage R;
14. Excellente maîtrise du français et de l’anglais, à l’oral comme à l’écrit;
15. Solides connaissances en génétique;
16. Capacité de travailler en groupe sur plusieurs projets;
17. Bonne compétence en « Data management »;
18. Expérience en gestion de projets et de personnel;
19. Expérience de travail sur les clusters de calculs.
Notre offre
20. Échelle salariale: Niveau 4 - entre 32.91 $ et 48.89 $ /heure (selon l’expérience de travail)
21. Chercheur responsable: Dr Sébastien Jacquemont
22. Poste : Régulier à temps complet (35 heures par semaine)
23. Date prévue d’entrée en fonction : Dès que possible
24. Autre : Le candidat sera également appelé à se déplacer, en fonction des besoins au Centre d’Innovation de GQ/McGill.

Avis important

Nous tenons à préciser que les candidats étrangers devront avoir un permis de travail valide pour le CHU Sainte-Justine. Tout permis de travail ayant la condition suivante ne sera pas éligible : « Pas autorisé à exercer un emploi relié aux soins des enfants, à l'enseignement au primaire ou au secondaire, au domaine de la santé ».

Veuillez utiliser notre site de recrutement pour postulez en ligne, seuls les candidats retenus seront contactés.

Fin de l'affichage : 3 février 2026

Autres avantages

1. Une conciliation travail et vie personnelle :

25. Plan de vacances avantageux
26. 20 jours de vacances par année, 25 jours de vacances dès la fin de la période de probation
27. 13 jours fériés
28. 9,6 jours de maladie par année
29. Congé de maternité, de paternité et d’adoption

2. Des avantages collectifs concurrentiels :

30. Régime de retraite à prestations déterminées (RREGOP)
31. Assurances collectives pour vous et votre famille
32. Programme d’aide aux employés et à leur famille
3. Des établissements facilement accessibles
33. Station de métro Université-de-Montréal, lignes d’autobus et grands axes routiers à proximité
34. Abri à vélos sécurisé et stations BIXI à proximité
35. Située dans le quartier Côte-des-Neiges
4. Des services sur place pour vous simplifier la vie:
36. Centre de la petite enfance Sainte-Justine
37. Nettoyeur et service de couture
38. Activités sportives
39. Service alimentaire qui encourage l’agriculture biologique et locale
40. Livraison de paniers de légumes biologiques
Remarques

Le genre masculin est utilisé sans discrimination et dans le seul but d’alléger le texte. Le CHU Sainte-Justine souscrit au principe d'accès à l'égalité en emploi et invite les femmes, les membres des minorités visibles et des minorités ethniques, les personnes handicapées et les Autochtones à poser leur candidature. Nous vous serions gré de nous faire part de tout handicap qui nécessiterait un aménagement technique et physique adapté à votre situation lors du processus de sélection. Soyez assuré que nous traiterons cette information avec confidentialité.