RESPONSABILITÉS :
Département-composante GEP -Laboratoire CREATIS
Contexte et Mission :
L'hypertension artérielle est une maladie cardiovasculaire répandue, affectant plus de 1.2 milliard de personnes dans le monde. Son diagnostic est difficile [1] en raison de la variété des symptômes et du manque d'outils d'analyse rapides et précis. Pour caractériser l'hypertension, les cliniciens s'appuient sur un ensemble élaboré de mesures d'anomalies structurelles et fonctionnelles extraites depuis des données d'imagerie. Nous avons récemment combiné des méthodes d'apprentissage de représentation et profond (auto-encodeurs et transformeurs), pour obtenir une représentation robuste et physiologiquement cohérente d'une population. Il s'agit d'estimer une représentation simplifiée de la population étudiée à partir de multiples descripteurs potentiellement haute-dimension issus des images et des données cliniques. À partir de données issues de l'échocardiographie 2D (séquences d'images dans des vues standard, et données cliniques associées), nous avons mis en évidence des profils subtils de formes et de déformations corrélés avec l'hypertension [2]. Dans ce contexte, la personne recrutée a pour mission d'étendre cette analyse afin de mieux caractériser le continuum de la pathologie, depuis des sujets normaux jusqu'à des cas sévères.
Activités principales :
La personne recrutée contribuera au développement de la chaine de traitement des données avec notamment, dans la
continuité de travaux récemment réalisés au laboratoire [2].
Elle ciblera notamment :
- La généralisation de l'extraction de descripteurs d'intérêt (par exemple, segmentation temporelle) à une cohorte de plus grande ampleur et/ou à de nouveaux descripteurs (par exemple, mouvement et déformation locale du myocarde),
- L'approfondissement des derniers développements méthodologiques réalisés au sein de l'équipe pour une extension clinique (1 article de journal clinique visé).
Conditions particulières d'exercice :
Le travail sera réalisé au Laboratoire CREATIS ( http://www.creatis.insa-lyon.fr/) sur le site Campus LyonTech-La Doua à Lyon, en interaction avec l'Université de Sherbrooke (Pierre-Marc JODOIN), et les Hospices Civils de Lyon (Pierre-Yves
COURAND). Des déplacements sur le site hospitalier seront nécessaires pour l'analyse de données et l'interaction avec notre collaborateur clinique. La personne recrutée interagira avec les permanents et les doctorants/post-doctorants de l'équipe impliqués.
PROFIL RECHERCHÉ :
Compétences attendues :
Nous recherchons un.e ingénieur.e en ingénierie logicielle avec une spécialisation en traitement et analyse de données, notamment images, avec si possible une expérience en analyse d'images médicales et les compétences suivantes :
Programmation : Python. Logiciels et librairies d'apprentissage profond.
Langue : maitrise de l'anglais technique écrit et oral.
Poste à pouvoir dès le 02/05/24
Le poste est ouvert aux contractuels de catégorie A - IGR
Rémunération mensuelle brute: 2935.7€
En rejoignant l'Université Lyon 1, vous pourrez bénéficier de :
- 48.5 jours de congés annuels, dès la première année universitaire, aménagement possible du temps de travail sur 4.5 jours, 37h30 / semaine, la possibilité d'avoir des jours de télétravail réguliers et/ou ponctuels, sous conditions,
- la participation au remboursement des frais de transport, forfait mobilité durable, aux frais complémentaire santé à hauteur de 15€/mois,...
- l'accès à des prestations d'action sociale, accès aux services de la crèche et du centre de loisirs situés sur le campus Lyon Tech La Doua
- l'accès aux activités artistiques et sportives de l'université, tarifs préférentiels loisirs,
- possibilités de développement professionnel en interne (concours, mobilité, formation continue et parcours professionnel)
- restauration sur le campus avec une participation financière de l'université
Experience: Débutant accepté
Qualification: Cadre
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