Ingénieur d'études en bioinformatique (h/f)

Informations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR5284-FREMOR-002 Date de début de diffusion 30/03/2026 Date de parution 31/03/2026 Date de fin de diffusion 20/04/2026 Intitulé long de l'offre Ingénieur d'études en bioinformatique (H/F) Date limite de candidature 20/04/2026 Nature du contrat CDD d'1 an Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Experte / Expert en biologie - SVT Statut du poste Vacant Intitulé du poste Ingénieur d'études en bioinformatique (H/F) Descriptif de l'employeur Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique. Description du poste Missions : Nous recrutons une ingénieure / un ingénieur en bioinformatique pour travailler sur un projet mêlant biologie du développement et cancérologie pédiatrique. La principale mission consistera à analyser de nouvelles données single-nuclei RNA-seq générées à partir d’un modèle de transplantation in vivo de cellules tumorales humaines dans leur territoire d’émergence au sein d’un embryon aviaire (Delloye-Bourgeois et al., Cancer Cell, 2017 ; Villalard et al., Nat Commun, 2024) Activités : • Analyse et traitement des données single-nuclei RNA-seq. • Comparaison des résultats obtenus avec des données de patients publiques ou des nouvelles données issues de collaborations. • Application de méthodes bio-informatiques pour l’annotation cellulaire, l’identification de sous-populations, l’analyse des trajectoires développementales, de communication cellulaire, d’enrichissement en processus biologiques etc. • Collaboration étroite avec les biologistes de l’équipe pour interpréter les résultats et orienter les analyses ainsi qu’avec les autres bioinformaticiens ou bioinformaticiennes de l’équipe ou d’équipe collaboratrice • Développement de pipelines pour automatiser le traitement des données et assurer leur reproductibilité. • Visualisation et présentation des résultats sous forme de rapports et de figures scientifiques. Contexte de travail : • Contrat : CDD de 12 mois à partir du 4 mai 2026. • Rémunération : Selon la grille CNRS (selon expérience). • Environnement : o Intégration dans une équipe d’environ 14 personnes, au sein du groupe thématique d’étude du neuroblastome. o Collaboration avec des équipes partenaires de divers instituts. o 44 jours de congés/RTT par an. o Horaires flexibles et bureaux confortables. o Remboursement partiel des transports (75%) forfait mobilité durable (jusqu’à 300€/an). o Participation financière à la mutuelle. o Site accessible en transports en commun. Conditions particulières d'exercice Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche. Descriptif du profil recherché Competences : • Formation : Master ou diplôme d’ingénieur en bioinformatique, biostatistiques souhaité. Une expérience confirmée en analyse de données single-cell ou single-nuclei RNA seq est indispensable. • Compétences techniques : -Maîtrise de R/Python et des outils d’analyse single-cell (Seurat, CellChat, GSEA, etc.). -Utilisation de GitHub pour la gestion de codes. -Anglais lu, écrit et parlé (pour la lecture de publications et les collaborations). • Qualités personnelles : Rigueur, autonomie, prise d’initiative et capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire Contraintes et risques : Temps plein Oui Rémunération contractuels (en € brut/an) 2521 € brut mensuel minimum Localisation du poste Europe, France, Auvergne-Rhône-Alpes, Rhône (69) Géolocalisation du poste LYON 08 Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 69008 LYON 08 (France) Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 6 Licence/diplômes équivalents Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie) Langues Français (Seuil)