Topic description
Résumé du projet en français : Ce projet de doctorat vise à combler les lacunes importantes dans la compréhension actuelle de la biologie et de la systématique des aleurodes. L'objectif principal est d'élucider les relations phylogénétiques au sein des aleurodes et de résoudre d'importants problèmes taxonomiques dans ce groupe important d'insectes ravageurs en utilisant des approches phylogénomiques. De plus, le projet développera une méthode d'identification fiable et rapide des aleurodes basée sur un panel de gènes nucléaires. Ces travaux en faciliteront la surveillance et la gestion. Pour ce faire, le/la doctorant۰e analysera les données génomiques d'espèces d'aleurodes importantes sur le plan agricole ainsi que d'espèces moins étudiées vivant dans des environnements naturels.
Le deuxième objectif de la thèse sera d'explorer le rôle des symbiotes bactériens dans la diversification des aleurodes. Ainsi, le/la doctorant.e explorera la diversité des symbiotes bactériens et leurs interactions métaboliques avec les aleurodes. Les gènes transférés horizontalement (THG) aux aleurodes peuvent conférer divers avantages aux aleurodes ; alors que certains semblent impliqués dans des fonctions symbiotiques, d'autres aident à contrer les défenses des plantes. Ainsi, les gènes codant pour les interactions métaboliques entre l'hôte et les symbiotes et les THG seront recherchés dans les génomes d'aleurodes. Ces gènes constituent des cibles génétiques potentielles pour la lutte contre les ravageurs. Enfin, le/la doctorant۰e évaluera également le potentiel des espèces d'aleurodes moins étudiées à agir comme vecteurs de pathogènes végétaux.
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Résumé du projet en anglais : This PhD project aims to fill critical gaps in the current understanding of whitefly biology and systematics. The primary objective is to elucidate higher relationships in whiteflies and resolve important taxonomic issues using phylogenomic approaches. Additionally, the project will develop a reliable and rapid identification method for whiteflies based on a panel of nuclear genes. Altogether, this will improve the taxonomy of this important group of insect pests to ultimately facilitate surveillance and management. To achieve this, the PhD student will analyze genomic data from agriculturally significant whitefly species as well as less-studied species living in natural environments.
Given the pivotal role of bacterial symbionts in whitefly diversification and their adaptation to new host plants and environments, the project will further explore bacterial symbionts and their metabolic interactions with whitefly hosts. Additionally, horizontally transferred genes (HTGs) confer various advantages to whiteflies; while some seem involved in symbiotic functions, others help counteract plants' defenses. Hence, genes encoding metabolic interactions between host and symbionts and HTGs will be sought for in whitefly genomes since they are potential genetic targets for pest control. Lastly, the PhD student will also assess the potential of less-studied whitefly species to act as vectors for plant pathogens. This project will expand our knowledge of the diversity and biology of whiteflies and their microbial associates, which is a prerequisite for the development of integrated pest management strategies
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Début de la thèse : 01/10/
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