Ingénieur de recherche en biologie et écologie moléculaire marine h/f

Informations générales

Réservé aux agents CNRS (fonctionnaires et CDI) et aux fonctionnaires et CDI de droit public
Intitulé de l'offre : Ingénieur de recherche en biologie et écologie moléculaire marine H/F
Référence : UMR7144-MOBINT-O55004
Lieu de travail : ROSCOFF CEDEX
Institut : INEE - Institut d'écologie et environnement
Date de publication : mardi 29 avril 2025
Session : Campagne Printemps 2025
Groupe de Fonction : IRG3
BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en laboratoire

Missions

L'ingénieur(e) sera chargé(e) de concevoir, développer, adapter et expérimenter de nouvelles méthodologies en biologie et écologie moléculaire appliquées à l'étude des micro-organismes marins.


Activités

-Définir un ensemble cohérent de techniques en biologie et écologie moléculaire (p. ex. (méta)omique), appliquées à l'étude des micro-organismes marins, à partir de culture ou d'échantillons environnementaux, incluant des matrices plus ou moins complexes et/ou à partir de matériel en quantité limitée ou dégradé.
- Concevoir, réaliser et/ou superviser la mise en œuvre opérationnelle, depuis le prélèvement en mer et/ou lors d'expérimentations en laboratoire jusqu'à la préparation du matériel adapté à l'approche moléculaire ciblée.
-Traiter les données (analyser, interpréter et valider les résultats).
-Diffuser et valoriser les résultats et les avancées technologiques sous forme de présentations orales et de publications scientifiques.
- Assurer une veille scientifique et technologique, et conseiller dans le choix des approches scientifiques et techniques en participant à la rédaction des demandes de financement.
- Transmettre et pérenniser cette expertise à travers le management et la formation des agents (chercheurs, ITA, post-doctorants et doctorants).
-Assurer l'application des principes et des règles d'hygiène et de sécurité.

Activité spécifique ou transverse :

-Prendre en charge l'animation scientifique et technique des plateformes technologiques de la FR2424 (GENOMER, MERIMAGE, ABIMS, RECYF, METABOMER, CRISTALO et KISSF). Partager les protocoles, participer aux discussions sur les futurs investissements, veille scientifique, etc.
- Contribuer à la gestion administrative et financière de l'équipe ECOMAP de l'UMR7144 : réalisation des devis, suivi des commandes, suivi du parc instrumental, rédaction de demandes de financements, suivi de projets, rédaction de plan de gestion des données.
-Préparer et participer aux missions sur le terrain de l'UMR7144.
-Participer aux activités de communication et de vulgarisation scientifique.




Compétences

Savoirs
-Connaissances approfondies, théoriques et pratiques, en biologie moléculaire et en microbiologie.
-Connaissances de la réglementation en matière d'hygiène et sécurité, d'éthique et du cadre légal et déontologique, liés à la manipulation des microorganismes et des produits chimiques.
-Pratique de l'anglais niveau B1 à B2.

Savoir-faire
-Maitriser les techniques de biologie moléculaire (Extraction, purification et dosage d'ADN et d'ARN sur échantillons de laboratoire et naturels, PCR, RT-PCR, qPCR, électrophorèse, clonage, préparation de librairies, séquençage, mini-preps, .
-Connaissances opérationnelles des logiciels, des bases de données et des outils informatiques (p. ex. environnement R, cluster de calcul) dédiés à l'analyse de séquences (alignement, blast, assemblage, contrôle qualité, phylogénie, et à l'analyse statistique de données.
-Compétences à la gestion informatique des activités de biologie moléculaire (p. ex. outil de partage d'informations dématérialisées, bases de données d'échantillons et/ou équipements).
-Maîtrise des techniques de présentations orales et écrites.

Savoir être
-Capacité à travailler en équipe et à animer un collectif.
-Capacité de raisonnement analytique.
-Autonomie, sens de l'organisation et capacité d'initiative (gestion de plusieurs projets simultanément).
-Rigueur/Fiabilité.


Contexte de travail

La Station biologique de Roscoff est un centre de recherche et d'enseignement en biologie et écologie marines, sous la double tutelle du CNRS et de Sorbonne Université.

Au sein de la SBR, la FR2424 regroupe les services communs mutualisés pour les deux unités de recherche du site, regroupant 300 personnes.

L'agent sera rattaché(e) à l'UMR7144 (Adaptation et Diversité en Milieu Marin, 90%), où son activité sera exercée principalement dans l'équipe ECOMAP, qui s'intéresse à la diversité génétique, l'écologie, la physiologie et l'évolution des organismes marins planctoniques et de leurs interactions à différentes échelles de temps et d'espace. L'ingénieur(e) participera également à des campagnes d'échantillonnage sur le terrain.
Au sein de la FR2424, l'agent interagira avec le personnel des PF technologiques de la station biologique de Roscoff, dont il assurera l'animation scientifique et technique pour les 10% restant de son temps.

L'activité de l'ingénieur(e) recruté(e) sera soumise à des horaires de travail standard. Toutefois, des aménagements horaires liés aux contraintes de traitements d'échantillons vivants et d'expérimentation au laboratoire ou sur le terrain pourront être nécessaires.

Placé.e sous la responsabilité directe de la directrice de l'UMR7144, l'agent interagit avec la directrice de la FR2424, les membres de l'équipe ECOMAP, les responsables des PF technologiques et l'ensemble des services communs de la FR2424.