Doctorant en biologie f/h

Mission :

La recherche porte sur l’implication de la signalisation RANKL dans deux pathologies du squelette en croissance que sont les défauts primaires d’éruption d’une part et les ostéosarcomes d’autres part. Ces deux pathologies sont étudiées au laboratoire depuis de nombreuses années avec un grand nombre de données collectées et publiées qui forment la base scientifique de cette recherche.

Dans le cadre du projet PRIRETORI soutenu par l’ANR et la DGOS, le/la Doctorant(e) aura pour mission :

* d’analyser les données de séquençage des gènes candidats (défauts primaires d’origine génétique) et de démontrer in vitro l’impact fonctionnel des variations identifiées,
* d’analyser dans un modèle in vivo les agents pharmaceutiques/chimiques suspectés d’induire une rétention primaire (origine environnementale) d’après les données issues du questionnaire d’exposition des patients.

Concernant les ostéosarcomes, le/la Doctorant(e) aura pour mission d’une part de décrypter le mécanisme à l’origine du développement d’ostéosarcomes par les souris invalidées pour le récepteur leurre de RANKL nommé ostéoprotégérine, et d’autre part à caractériser les facteurs de prédétermination métastatique exprimés par les lignées de cellules issues de ces tumeurs qui présentent un très fort potentiel métastatique.

Activités :

* Analyser les résultats de NGS (WGS, WES, capture),
* Mettre en place des stratégies et des techniques de biologie moléculaire et cellulaires pour évaluer l’impact des variations géniques identifiées par NGS,
* Analyser et interpréter les données de RNA-Seq,
* Mettre en place des stratégies et des techniques de biologie moléculaire et cellulaires pour évaluer l’expression des transcrits et des protéines, afin de confirmer ou compléter les données obtenues par des approches RNA-Seq,
* Cultures de cellules tumorales murines et humaines, transfection/infection, analyses des conséquences in vitro sur les principaux processus cellulaires (prolifération, apoptose, migration, invasion, métabolisme…), et in vivo après injection chez la souris.
* Analyser les conséquences sur l’éruption dentaire et la croissance squelettique d’injections d’agent pharmacologiques/chimiques chez la souris en croissance.
* Présentations orales des résultats scientifiques en interne et lors de manifestations scientifiques,
* Rédaction de publications scientifiques
* Encadrement d’étudiants et de personnels techniques
* Réalisation d’une veille scientifique






Connaissances :

* Solides connaissances en Odontologie
* Solides connaissances en Oncologie.
* Solides connaissances scientifiques en biologie humaine,
* Connaissance des outils bio-informatiques et des bases de données couramment utilisés en génétique humaine,

Savoir-faire :

* Maîtrise de la culture cellulaire,
* Maîtrise des outils bio-informatiques utiles à l’analyse de données de RNA-Seq, WGS et WES
* Maîtrise des outils d’analyse des atteintes squelettiques (radiographies, micro-CT…)
* Maîtrise des techniques de biologie moléculaire et cellulaire, technologies dérivées du NGS (clonage, transfection, transduction, CRISPR-Cas9, RT-qPCR, immunomarquage, western blot et autres techniques classiques de biologie moléculaire et cellulaire)

Aptitudes :

* Rigueur scientifique,
* Capacités rédactionnelles,
* Bonne communication dans le cadre d’un travail en équipe.

Diplôme /Formation :

* M2 en Biologie //Oncologie ou équivalent



Expérience souhaitée :

* Expérience en Odontologie clinique
* Expérience en culture cellulaire
* Expérience dans l’interprétation de données d’OMICs
* Expérience en biologie cellulaire et moléculaire


L’Inserm est le seul organisme public français entièrement dédié à la recherche biologique, médicale et en santé des populations. Il dispose de laboratoires de recherche sur l’ensemble du territoire, regroupés en 12 Délégations Régionales. Notre institut réunit 15 000 chercheurs, ingénieurs, techniciens et personnels administratifs, avec un objectif commun : améliorer la santé de tous par le progrès des connaissances sur le vivant et sur les maladies, l’innovation dans les traitements et la recherche en santé publique.

L’UMR_S933 est une unité mixte de recherche (Inserm //Sorbonne Université) localisée à l’hôpital Armand-Trousseau. Cette unité est dédiée à l’étude des bases moléculaires et cellulaires de plusieurs maladies rares d’origine génétique. L’unité est aujourd’hui structurée autour de 3 grands axes médico-scientifiques : 1/ maladies pulmonaires : dyskinésies ciliaires primitives et pneumopathies interstitielles diffuses ; 2/ maladies auto-inflammatoires ; et 3/ certaines maladies du développement (maladies de la croissance et anomalies du développement sexuel).

Pour chaque pathologie investiguée, nous développons en plus d’un volet génétique, un volet fonctionnel reposant sur des approches complémentaires visant (i) à caractériser les réseaux moléculaires auxquels appartiennent les protéines impliquées et (ii) à évaluer, dans différents systèmes modèles, les conséquences des mutations identifiées chez les patients. Pour certaines de ces maladies, la recherche de nouvelles pistes thérapeutiques est aussi un de nos objectifs. Il s’agit d’une recherche à la fois fondamentale et translationnelle qui s’appuie sur une collaboration privilégiée avec plusieurs centres de références de maladies rares ainsi qu’avec le laboratoire hospitalier de diagnostic moléculaire attenant au laboratoire de recherche.

Site internet : http://www.geneticdiseases-lab.fr/