Offre de thèse en biophysique et biologie structurale (h/f)

Informations générales

Intitulé de l'offre : Offre de thèse en biophysique et biologie structurale (H/F)
Référence : UMR5048-FLOLEP-113
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : mercredi 16 juillet 2025
Type de contrat : CDD Doctorant
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 1 octobre 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : La rémunération est d'un minimum de 2200,00 € mensuel
Section(s) CN : 20 - Biologie moléculaire et structurale, biochimie

Description du sujet de thèse

Vers une description quantitative de la dynamique structurale des hétérodimères de GPCR par FRET sur molécule unique.

Contexte de travail

Nous proposons un poste de doctorant ou doctorante entièrement financé à l’interface de la biophysique et de la biologie structurale, au sein du groupe « Biophysique Intégrative des Membranes » au Centre de Biologie Structurale (CBS) à Montpellier, France. Notre groupe étudie les mécanismes moléculaires d’activation des récepteurs couplés aux protéines G (GPCR) et la transduction du signal, avec un accent particulier sur la façon dont les ligands et les transducteurs modulent leur paysage conformationnel et leur dynamique.

Présentation du projet
Les GPCR jouent un rôle central dans la signalisation cellulaire et représentent des cibles majeures pour le développement de médicaments. Bien que les structures statiques aient permis de visualiser les états conformationnels principaux a haute résolution, les transitions dynamiques qui sous-tendent l’activation - notamment celles déclenchées par différentes classes de ligands et de transducteurs - restent mal comprises. Ce projet de thèse vise à élucider les équilibres et les cinétiques d’activation de certains hétérodimères de GPCR en combinant FRETsur molécule unique (smFRET) avec un mélange microfluidique rapide.

Pourquoi la smFRET ?
Contrairement aux techniques moyennées sur un grand nombre de molécules comme la cryo-EM ou la cristallographie aux rayons X, la smFRET permet une observation en temps réel, molécule par molécule, du paysage conformationnel des protéines. Cette technique permet de suivre directement les dynamiques et les transitions entre plusieurs états fonctionnels des GPCR, même lorsqu’ils sont transitoires ou faiblement peuplés. De plus, en association avec le mélange microfluidique rapide, la smFRET permet d’obtenir des informations quantitatives sur les changements conformationnels liés à l’activation par un ligand, avec une résolution sub-nanomètre et une dynamique sub-millisecondes. Cela représente un grand potentiel pour comprendre les étapes initiales de la signalisation, qui échappent aux méthodes structurales classiques.

Votre rôle
• Concevoir, construire, exprimer et purifier des mutants de GPCR à partir de cellules de mammifères pour un marquage site-spécifique via des acides aminés non naturels et des chimies bioorthogonales selon les protocoles établis dans notre laboratoire
• Concevoir, fabriquer et mettre en œuvre des dispositifs microfluidiques pour le mélange rapide
• Réaliser des expériences de smFRET à l’équilibre et en conditions de mélange rapide
• Déterminer les distances entre sondes et les dynamiques conformationnelles de manière quantitative
• Collaborer avec des membres de l’équipe ayant une expertise complémentaire en biochimie, biophysique, nanotechnologie et biologie structurale

Profil du candidat ou de la candidate
• Diplôme de Master en biophysique ou biologie quantitative (ou biologie structurale, biochimie ou domaine connexe avec de solides bases en biophysique)
• Expérience en microscopie/spectroscopie de fluorescence, idéalement à molécule unique
• Expérience de base en biologie moléculaire et expression de protéines (préférence pour les systèmes de mammifères)
• Connaissances de base en codage et modélisation/simulations structurales appréciées
• Fort intérêt pour les relations structure-fonction des protéines membranaires
• Bon niveau d’anglais parlé et écrit

Nous offrons
• Un environnement de recherche collaboratif, interdisciplinaire et bienveillant
• Une co-direction par E. Margeat (biophysicien) et. Quast (biochimiste)
• Accès à des plateformes de pointe en fluorescence à molécule unique et biochimie des protéines membranaires
• Un accompagnement et des opportunités de développement de carrière
• Financement pour 3 ans (avec possibilité de postuler pour une 4e année)
• Possibilités de présentations dans des conférences internationales

Contraintes et risques

Veuillez envoyer les documents suivants dans un seul fichier PDF :
• Lettre de motivation expliquant vos intérêts scientifiques
• CV avec parcours académique, notes et expériences de recherche
• Noms et coordonnées de 2 référents académiques minimum
• Copie de votre mémoire de master ou toute publication