Post-doctorat en genomics (bio-informatique) (h/f)

Post-doctorat en Genomics (bio-informatique) (H/F), Paris

L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche et de la lutte contre le cancer. Il est constitué d'un hôpital et d'un Centre de recherche de plus de 1000 collaborateurs avec une forte représentativité ’objectif du Centre de recherche de l’institut Curie est de développer la recherche fondamentale et d’utiliser les connaissances produites pour améliorer le diagnostic, le pronostic, la thérapeutique des cancers dans le cadre du continuum entre la recherche fondamentale et l’innovation au service du malade.

Nous recherchons des post-doctorants pour rejoindre notre équipe ARN NON CODANTS, ÉPIGÉNÉTIQUE, ET FLUIDITÉ DES GÉNOMES dirigée par Antonin MORILLON (), à l'Institut Curie, Paris, France. Nos intérêts de recherche se concentrent sur les ARN non codants (ncRNA) régulateurs. Chez les eucaryotes supérieurs, il a été démontré que les ncRNAs régulateurs régulent l'expression des gènes, les domaines chromatiniens et la stabilité du génome. Les ncRNA régulateurs peuvent être classés en petits ARN non codants qui participent aux voies de l'interférence ARN (RNAi); et en longs ARN non codants d'au moins 200 nucléotides de longueur. Ces derniers transcrits représentent la classe la plus répandue de gènes non codants dans le génome humain et montrent une grande diversité de structure et de fonctions.

Nous développons des approches originales de séquençage à haut débit et de calcul permettant des études transcriptomiques exhaustives chez la levure et chez l'homme et l'identification de nouvelles espèces de lncRNA. Ils sont ensuite étudiés pour leur destin et leur fonction dans les deux systèmes eucaryotes. Enfin, nous étudions la pertinence clinique des lncRNAs en tant que biomarqueurs pronostiques non invasifs.

Projet de recherche

Les cancers du sein triple négatifs (TNBC) ont le pire pronostic parmi les cancers du sein et manquent de cibles moléculaires codantes Il a été démontré que les ARN longs non codants (lncRNAs) et les circRNAs sont impliqués dans différentes étapes de la biologie du cancer. Notre objectif est d'identifier un ensemble complet de données sur les lncRNAs, les circRNAs et les nouveaux gènes circulants acellulaires (dans les vésicules extracellulaires) jouant un rôle dans la chimiorésistance du TNBC et l'échappement de la réponse immunitaire, et de nous concentrer sur le phénotype et la fonction associés à la dérégulation des lncRNAs les plus importants. Notre recherche est financée par une subvention INCA en collaboration avec le laboratoire de Clotilde Théry (Curie).

1. Andjus et al. RNA 2024, 3

2. Bhargava et al. iScience 2023, 26, 12, 108449

3. Foretek, et al. Research Square 2023

4. Yague-Sanz et al. Nat Commun 2023, 14, 3587.

5. Almeida et al. JEv 2022, 11 (5), e12210

6. Jarroux, et al. EMBO Rep 2021, 22: e50193

7. Morillon A & Gautheret D. Genome Biol 2019, 20, 1–7.

- Le/la candidat-e doit être bio-informaticien-ne titulaire d'un doctorat en biologie, biologie cellulaire ou dans des domaines connexes.

- Récemment Diplômé-e ou avec 3 ans d'expérience postdoctorale maximum. Les candidats sont invités à indiquer leur niveau spécifique d'expérience dans ces domaines.

o Expertise dans l'analyse des ensembles de données transcriptomiques.

o Maîtrise d'au moins un langage de programmation pour l'analyse de données (R, Python)

o Compétences en Linux et infrastructure de superordinateur (Slurm ou autre).

o Optionnel : expérience avec (NextFlow, SnakeMake) et la conteneurisation (Docker, Singularity)

- Compétences linguistiques : Maîtrise de l'anglais courant et compétences en communication. Le français est un atout.

Aptitudes requises

· Capacité à travailler de manière autonome, compétences managériales, aptitude au travail en équipe.

· Le/la candidat doit être très motivé-e, curieux-se et enthousiaste à l'idée de travailler au sein d'une équipe collaborative.

Toutes nos opportunités sont ouvertes à des personnes en situation de handicap.

Informations sur le contrat

Type de contrat : COD

Date de démarrage: Dès que possible

Durée du contrat : 18 mois (contrat renouvelable jusqu'à 3 ans)

Temps de travail : Temps complet

Rémunération : selon les grilles en vigueur

Avantages : Restauration collective, prise en charge du titre de transport annuel à 70%, mutuelle d’entreprise

Localisation du poste : Paris

Référence : NA

Contact

Pour postuler, merci d’envoyer CV et lettre de motivation

Les CV seront traités au fur et à mesure, par conséquent le poste pourrait être pourvu avant la date limite de dépôt des candidatures.

Date de parution de l’offre : 05/06/2024

Date limite des candidatures: 30/09/2024

L'Institut Curie est un employeur inclusif respectant l'égalité des chances.

Il s’engage également à appliquer des normes exigeantes en matière d'intégrité de la recherche.

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