Ingénieur.re en biotechnologies du caféier (culture in vitro et édition des génomes)

Description du poste

/ de la mission

L’adaptation des plantes au changement climatique représente un défi majeur pour l’agriculture mondiale. Comme beaucoup d’arbres tropicaux, le caféier est particulièrement sensible à ces changements, qui affectent déjà la production et la répartition géographique des cultures, avec des conséquences socio-économiques importantes pour la filière et les agriculteurs qui, dans la majorité des cas, sont de petits producteurs très vulnérables.
La plupart des variétés actuelles ne sont plus adaptées aux nouvelles pressions exercées par ces changements globaux. Les processus de sélection classiques étant longs (environ 30 ans pour créer une nouvelle variété), les sélectionneurs se sont tournés vers les biotechnologies, notamment l’embryogénèse somatique ou la culture in vitro (CIV[DL1] ) afin d’accélérer la sélection et la multiplication des nouvelles variétés telles que les hybrides F1 plus tolérants aux différents stress (a)biotiques, plus productifs et particulièrement adaptés à l’agroforesterie. L’analyse fonctionnelle des gènes via la transgénèse et l’amélioration rapide et ciblée de certains caractères, grâce à l’édition du génome (EG), nécessitent également le recours à la CIV. Le CIRAD, pionnier dans le développement de ces nouvelles biotechnologies chez le caféier, a développé de nombreuses innovations et a su construire un réseau de collaborations durables au sein de la filière café, dans l’objectif est d’avoir un impact concret sur le secteur café.
Dans ce contexte, le CIRAD recrute, pour l'UMR DIADE, un.e ingénieur.e en biotechnologies végétales. La personne recrutée aura pour mission principale d’animer l’atelier d’édition des génomes de Montpellier et d’appuyer par ses connaissances en CIV les programmes de sélection et de dissémination des nouvelles variétés de café en collaboration avec nos partenaires du sud et du nord. [DL2]
Il.elle sera en charge de développer les activités suivantes chez le caféier : (1) La production in vitro, la conservation et la traçabilité du matériel végétal en appui aux différents projets de recherche en amélioration génétique et édition du génome (cals, suspensions, plantules etc.), (2) L’optimisation des protocoles de culture in vitro et d’édition des génomes (production, transfection et tri de protoplastes, régénération de plantules à partir de protoplastes isolés, construction de plasmides, génotypage des plantes éditées etc.), (3) Participer au transfert technologique des méthodes de propagation de masse et d’édition du génome des caféiers afin de renforcer les compétences et l’autonomie de nos partenaires du sud et au déploiement en partenariat des variétés ECOM-CIRAD [DL3] [GMTH4] dans toute la zone intertropicale, (4) Participer au montage et à la coordination de projets sur l’édition du génome et mobilisant la CIV et à l’animation du réseau EDITROP (EDItion du génome des plantes TROPicales et méditerranéenne), en collaboration avec les UMRs AGAP et PHIM[DL5] .





Profil souhaité

- Vous êtes titulaire d'un diplôme de Master, ingénieur ou PhD avec si possible une première expérience professionnelle dans le secteur public (ex : centre de recherche) ou privé (ex : compagnie semencière) ;


- Vous possédez de bonnes connaissances théoriques et techniques en culture in vitro et biotechnologies végétales ;

- Vous avez un goût particulier pour l'expérimentation en laboratoire ainsi que pour les missions d’expertise, de transfert de connaissances/technologies) et de formation du personnel (partenaires, étudiants) sur le terrain en zone tropicale ;

- Vous maitrisez les techniques de biologie moléculaire (ex : extraction d’ADN, ARN, clonage de plasmide, transformation génétique, génotypage) ainsi que les nouvelles techniques de génomique (NTG) comme l’édition du génome ;


- Vous êtes capable d’organiser votre travail et de suivre rigoureusement les protocoles expérimentaux qui vous sont confiés afin de garantir la reproductibilité des résultats et de les optimiser lorsque cela s’avère nécessaire ;

- Vous êtes capable de restituer les résultats par écrit sous forme d’articles scientifiques ;

- Vous avez une appétence pour l’animation d’ateliers et de réseaux dans vos domaines de compétence (CIV) ;

- Vous avez un intérêt fort pour le travail collaboratif/en partenariat (notamment sud) et êtes capable de collaborer sur différents projets à la fois ;

- Vous appréciez de pouvoir exercer certaines de vos activités en mobilité (missions) auprès des partenaires sud.

- Vous êtes en mesure de, et vous êtes motivé.e pour, participer, avec des chercheurs expérimentés dans le domaine, au montage de projets et à l‘animation des partenariat s notamment avec le secteur privé ;[DL1]


- Enfin, vous maitrisez le français et l’anglais.

Contraintes du poste

Gestes répétitifs

Déplacements France et étranger fréquents

Poste ouvert aux

Cadre

Salaire base France, hors indemnités d'expatriation le cas échéant

à partir de 31k€ selon expérience