Ingénieur-e d étude en expérimentation et production végétales

Vos missions en quelques mots Dans un contexte de crise climatique et de dépérissement forestier croissant, la plantation permet de renouveler les peuplements dans des situations où la régénération naturelle ne fournit pas les semis attendus. Mais, ces plantations forestières sont elles-mêmes soumises à des mortalités élevées en 1ère année quand les sécheresses printanières et estivales sont très marquées. Afin de réduire la mortalité initiale, il a été proposé d’utiliser des plants inoculés en pépinière par des champignons ectomycorhiziens qui pourraient améliorer le prélèvement en eau du sol des jeunes plants et améliorer le succès des plantations. L’objectif général du projet est i) d’étudier la survie et la croissance des plants, mycorhizés artificiellement en pépinière, sur des parcelles forestières durant les épisodes de sécheresses printanières et estivales, et en serre sous contraintes hydriques et ii) de mesurer la persistance des espèces fongiques ectomycorhiziennes introduites en plantation, et les effet sur le cortège microbien indigène (étude par metabarcoding). L’interaction et la compatibilité de cette technique avec d’autres pratiques sylvicoles seront également évalués et des stratégies d’amélioration de la mycorhization contrôlée en amont et en aval des plantations seront testées. En collaboration avec d’autres équipes et personnels associés, vos activités se partageront entre terrain, serre, laboratoire et bureau. Vos missions consisteront à : • Gérer le projet, en relation avec divers partenaires (recherche académique et parties prenantes publiques et privées). • Réaliser des cultures de plantes en absence ou présence de microorganismes, en culture in vitro et en serre. Organiser les ressources nécessaires aux expérimentations. • Produire des cultures de microorganismes (maintien et préparation d’inoculum). • Participer au suivi d’expérimentations sur deux plantations forestières de la Région Grand-Est. • Effectuer des mesures sur plants et réaliser des échantillonnages (sol et racines). Prendre en charge les analyses d’écologie moléculaire (extraction d’ADNe, PCR, production de « librairies » pour le metabarcoding, traitements et analyses des données meta-omiques, etc.). • Organiser et analyser les données recueillies. Rédiger et présenter les comptes-rendus des résultats, rédiger des rapports, participer à la rédaction des articles scientifiques et techniques. Profil recherché • Compétences et expériences en écologie moléculaire microbienne et analyses de données de type « méta-omiques ». • Intérêt marqué ou expérience pour l’expérimentation et pour le développement technique. Aptitudes au travail de terrain et de laboratoire. • Intérêt marqué pour la physiologie et/ou la biologie végétale. • Compétences en analyses statistiques sous R. • Autonomie, rigueur et organisation. Bonnes aptitudes à la rédaction. • Goût pour le travail en équipe. Envoyer le dossier de candidature sous forme électronique (lettre de motivation, CV détaillé et les coordonnées de personnes référentes). Niveau d'études minimum requis Niveau Niveau 6 Licence/diplômes équivalents