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Ingénieur·e en caractérisation de levures h/f

Montpellier
INRAE
Publiée le 9 juin
Description de l'offre

Le CIRM-Levures est un CRB (Centre de Ressources Biologiques) microbien dédié à la conservation des levures d'origine alimentaire et environnementale. Il fait partie du GIS CIRM, distribué sur 5 sites, composante de l'infrastructure INRAE RARe et l'infrastructure Européenne MIRRI. Ce poste est situé à Montpellier, dans l'unité de recherche (UMR) SPO, une unité leader pour ses travaux sur les fermentations oenologiques et de panification. Cette unité comprend également deux plateformes, l'une de métabolomique des polyphénols, et la seconde de culturomique attachée à l'unité Ferments du Futur.
Les CRB microbiens font face à un tournant de leur activité face à (i) l'essor de la caractérisation génomique des ressources microbiennes des collections, (ii) le développement des approches de culturomique associées à l'exploration des microbiotes, (iii) la caractérisation taxonomique haut débit des ressources et (iv) la nécessité de disposer de données physiologiques pour répondre aux demandes des utilisateurs.
Votre mission première sera de prendre en charge l'organisation et la mise en oeuvre de la caractérisation génomique et phénotypique des ressources du CRB, et ce, à haut débit. Cela inclut aussi la logistique d'acquisition des données, leur traitement et la mise à disposition au travers du système d'information du CIRM-Levures. Un soin particulier sera accordé à la mise en place de la FAIRisation des données. Cette activité sera menée en lien avec les plateformes de génomique, de métabolomique et de phénomique INRAE, et avec l'appui de l'expertise bioinformatique eucaryote présente à SPO. Vous participerez au développement de l'expertise taxonomique phylogénomique du CRB. Enfin, vous participerez à l'enrichissement des ressources du CIRM au travers d'activités de culturomique appliquée aux levures.
A terme, vous deviendrez le responsable du CIRM-Levures. A ce titre, vous serez la personne référente sur les ressources levures dans le GIS CIRM et l'unité SPO, et serez le point focal pour les collaborations internationales et nationales sur ce sujet. Le CIRM-Levures fonctionne aujourd'hui avec 2 personnes à temps plein (1 assistant ingénieur et 1 technicien) dont vous assurerez le management.Poste ouvert uniquement aux fonctionnaires et aux agents en CDI de la Fonction Publique.

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