Alternance - technicien de recherche génomique h/f/x

Référence 2026-16808 Date de début de diffusion 16/03/2026 Date de parution 16/03/2026 Métier Biologiste - Stagiaire Santé (Biologiste) Intitulé du poste ALTERNANCE - Technicien de recherche génomique H/F/X En français : titre du projet de recherche (si CDD scientifique)/sujet de stage/sujet d'apprentissage/objet de l'accueil) Contrat d'alternance L3 spécialité génomique ou biologie moléculaire : Générer une collection de librairies de séquençage MetaHiC de communauté microbienne complexe Contrat d'alternance L3 spécialité génomique ou biologie moléculaire : Generate a collection of MetaHiC sequencing libraries of the human microbiota from a mother-child cohort Missions/Activités L'Institut Pasteur conduit des recherches biomédicales de pointe et avant-gardistes depuis plus de 130 ans. Sur notre campus de 5 hectares en plein Paris (15è arrondissement), dans un environnement multiculturel et stimulant, 3000 personnes collaborent pour répondre aux ambitions de l'Institut Pasteur. ALTERNANCE - Technicien de recherche génomique H/F/X L'étudiant.e travaillera au sein de l'équipe Régulation spatiale des génomes, située à l'Institut Pasteur de Paris, dirigée par le Pr. Romain Koszul, sous la direction de Pauline Larrous, ingénieure de recherche. Sa mission sera de produire des librairies d'une approche génomique maitrisée par le laboratoire et appelée metaHiC à partir d'échantillons provenant du microbiote intestinal d'une cohorte mère-enfant originaire de Bangui, en République Centrafricaine. Et ce, afin d'y caractériser des déséquilibres et d'en identifier les causes. Missions Les activités de l'étudiant.e consisteront à : • pré-traiter les centaines d'échantillons de cette cohorte reçus et disponibles au laboratoire, à maintenir la traçabilité des traitement grâce à notre système de cahier de laboratoire électronique, • à poursuivre l'application de la technique de metaHiC grâce à des kits. • enfin, des librairies de séquençage haut débit type Illumina seront générées, séquencées et les données stockées sur les bases de données du laboratoire. Un travail de synthèse des résultats sera attendu de sa part afin de valider la qualité des librairies avant leur séquençage NGS. L'étudiant.e pourra participer à l'analyse informatique des données si il/elle le souhaite, en sachant que des informaticiens travaillent dans le laboratoire. Cette participation pourra également se faire sous forme d'observation, suivant les compétences précises du candidat.e. Profil ✅ Profil Etudiant.e en L3, ayant auparavant suivi une formation technologique de type DUT ou BTS avec une spécialité en génomique et/ou biologie moléculaire. Des compétences de bases en techniques de biologique moléculaires sont attendues. Une formation au sein de l'équipe sera assurée pour acquérir la maitrise de la technique de metaHiC requise pour le projet, de même que pour la construction en série de grande quantité de librairies de séquençage. Candidat·e très motivé·e et doté·e d'un fort esprit d'équipe et d'autonomie. Rigueur, efficacité, et surtout communication claire sur les expériences en cours, aussi bien sur les réussites que les échecs, sont essentiels. La maîtrise de l'anglais est d'intérêt mais pas fondamentale à ce stade du projet, les encadrants étant francophones. Compétences acquises à l'issue de votre stage/période d'apprentissage L'étudiant·e sera formé·e à des techniques standards de génomique (fabrication de librairies) et deviendra autonome sur ces activités. Il sera formé sur des techniques d'études plus rares permettant de caractériser la conformation 3D de l'ADN telle que metaHiC (qui permet d'identifier les interactions physiques entre épisomes type virus ou plasmides, et les génomes bactériens), la création de librairies de metaHIC et leur séquençage. L'autonomie acquise sur ces techniques utilisées au sein du laboratoire lui permettra de réaliser des librairies de metaHiC d'échantillons de microbiote intestinal d'une cohorte mère-enfant de manière autonome. L'étudiant·e sera amené·e à référencer ses résultats au sein de notre système de cahier de laboratoire électronique, à analyser la qualité des librairies produites, à rapporter ses résultats à son directeur de stage et à les présenter de manière synthétique en réunion de laboratoire. Vos conditions et environnement de travail : • L'Institut Pasteur s'engage à offrir un environnement de travail inclusif et respectueux. Nous accueillons toutes les candidatures répondant aux critères du poste, en valorisant la diversité sous toutes ses formes et les parcours variés. • Forfait mobilité douce ou remboursement de 75% des titres de transport • Cantine d'entreprise, restaurants, cafétérias • Salles de sports, 30 activités culturelles/artistiques/sportives sur le campus • Engagements RSE forts, et initiatives des collabora Déplacements Pas de déplacements Critères candidat Niveau d'étude souhaité Bac 3 Certification ou habilitation requise Aucune Compétences linguistiques Anglais (B1 - Intermédiaire) Localisation du poste France, Paris Lieu NA Poste à pourvoir le 09/09/2026