Mission de soutien et de formation en bioinformatique, en culture cellulaire et en analyses génomiques fonctionnelles, visant à mieux comprendre les interactions entre les facteurs de transcription (FTs) et les voies de signalisation extracellulaires, notamment TGF- et BMP
Activités
Réaliser des cultures cellulaires, incluant la différenciation de cellules souches en organoïdes spinaux
Développer des pipelines bioinformatiques accessibles au plus grand nombre, pour analyser et comparer les profils de recrutement de protéines au niveau du génome
Mettre en place et optimiser la technique de ChIP-seq afin d'analyser le recrutement de facteurs en aval des voies de signalisation TGF- et BMP
Compétences
Solide expérience en culture cellulaire, notamment en différenciation de cellules souches en organoïdes
Connaissances pratiques des techniques de biologie moléculaire et cellulaire, en particulier ChIP-seq
Compétences en bioinformatique, incluant le développement de pipelines pour l'analyse de données génomiques (profil de recrutement de protéines, analyse de séquences, etc.)
Capacité à rendre les outils bioinformatiques accessibles et utilisables par des non-spécialistes
Bonne compréhension des voies de signalisation cellulaires, en particulier TGF- et BMP
Autonomie, rigueur et sens de l'organisation dans la conduite expérimentale et l'analyse des résultats
Aptitude à travailler en équipe dans un environnement de recherche pluridisciplinaire
Capacité à communiquer efficacement les résultats, à l'oral (réunions, séminaires) comme à l'écrit (rapports, publications)
Maîtrise de l'anglais scientifique (lu, écrit, parlé)
Contexte de travail
La personne recrutée travaillera au sein de l'équipe « Neurodéveloppement humain et maladies », dirigée par Vanessa Ribes et Stéphane Nedelec, en interaction avec différents membres du laboratoire.
Contraintes et risques
Travail en laboratoire de niveau de confinement L2
Possibilité d'astreintes ponctuelles le week-end selon les besoins expérimentaux
Travail prolongé sur écran, notamment pour l'analyse de données bioinformatiques
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