Merci d’envoyer votre candidature (CV+LM) à roulland@ciml.univ-mrs.fr avec pour objet « Candidature bio-informaticien MRDeep ».
PROJET MRDeep
Description du poste :
L’Institut Paoli-Calmettes, en partenariat avec l’équipe de Sandrine ROULLAND au Centre d’Immunologie de Marseille Luminy (CIML), recrute un ingénieur en bio-informatique.
Vous serez responsable de l’analyse de données de single-cell et de la coordination d’un projet centré sur la caractérisation de la maladie résiduelle dans les hémopathies malignes dérivant des lymphocytes B.
Ce projet est soutenu par le consortium CALYM.
Responsabilités :
1. Analyser les données single-cell pour caractériser les cellules tumorales de lymphome folliculaire (FL), de leucémie lymphoïde chronique (LLC) et de myélome multiple (MM) persistant post-traitement, ainsi que leur microenvironnement de soutien (TME).
2. Collaborer avec plusieurs équipes du consortium CALYM dans le cadre du projet MRDeep.
Environnement de travail :
Vous serez accueilli au sein de la plateforme de bio-informatique du CIML, située sur le campus de Luminy à Marseille.
Vous travaillerez avec une équipe d’experts en bio-informatique et aurez accès à un cluster de calcul combinant CPU et GPU.
Vous serez également en immersion dans l’équipe de recherche du Dr ROULLAND et collaborerez avec le Dr BRISOU, hématologue à l’Institut Paoli Calmettes et porteur du projet MRDeep.
Compétences requises :
Maîtrise des langages de programmation : Python, R, bash.
Expérience avec les outils single-cell : Seurat, Scanpy.
Compétences en méthodes d’analyse : normalisation, intégration, mapping, analyse différentielle, analyse de trajectoire, analyse de répertoires.
Capacité à présenter les résultats de manière synthétique sous forme de rapports, publications et présentations orales.
Veille scientifique et technologique dans le domaine du single-cell.
Goût pour les projets mêlant bio-informatique et biologie.
Compétences en coordination de projet et travail en équipe.
Capacité à échanger et partager des outils avec les équipes collaboratrices.
Maîtrise de l’anglais oral.
Modalités du contrat : CDD 12 mois, démarrage dès que possible.
Merci d’envoyer votre candidature (CV+LM) à roulland@ciml.univ-mrs.fr avec pour objet « Candidature bio-informaticien MRDeep ».
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