Description de l'offre
Contexte : La détection colorimétrique constitue une méthode simple, rapide et peu coûteuse pour révéler la présence d’un analyte ou suivre l’évolution d’une réaction. Au LMSE (CEA Grenoble), des expériences menées sur plaques à 96 puits ont montré l’intérêt de cette approche pour la détection de toxiques. Au SCBM (CEA Saclay), une plateforme d’expérimentation à haut débit a été développé, permettant la miniaturisation et la parallélisation de réactions chimiques au format 96 puits. Dans le cadre d’une collaboration entre les deux laboratoires, nous souhaitons standardiser l’acquisition d’images et développer un outil de traitement automatisé, afin de garantir une étude de haute qualité, reproductible et accessible à l’ensemble du laboratoire.
Objectif du stage : Ce stage s’inscrit dans le développement d’un outil complet de suivi colorimétrique automatisé de plaques multi-puits.
Il s’agira également d’éprouver la robustesse du protocole sur des applications en lien avec la collaboration LMSE/SCBM.
Vous serez amené à :
- Mettre en place des conditions reproductibles (paramètres d’éclairage, caméra) d’acquisition et établir des moyens de calibration pour définir un protocole de standardisation d’acquisition d’image.
- Mettre au point des corrections d’écarts de couleurs et automatiser l’extraction d’information colorimétrique des photos de suivi standardisées. Le développement d’une interface graphique sera attendu pour faciliter le traitement des images de plaques réactionnelles et de virages colorimétriques.
- Préparer des plaques de solutions de molécules afin de valider le montage du laboratoire de Saclay et le fonctionnement du logiciel. Ces plaques seront également utilisées pour effectuer des tests de détection d’analytes (HCl, NH3, …) par voie colorimétrique.
En parallèle, la simulation de couleurs pourra être réalisée à partir de calculs DFT, permettant de compléter des modèles de prédiction de couleurs existants dans nos laboratoires.
Ce stage permettra au/à la stagiaire de renforcer ses compétences à l’interface de la chimie et de la chémoinformatique.
Le stage faisant objet d’une collaboration entre deux équipes, vous serez amené à effectuer des déplacements pris en charge par le CEA entre le site de Grenoble et le site de Paris Saclay.
Profil du candidat
Vous avez suivi un cursus type M2 en chimie organique ou analytique et avoir une appétence pour le codage en python. Des connaissances en traitement d’image serait un plus.
Le/la candidat(e) doit être autonome, motivé(e) et faire preuves de bonnes capacités de communication pour interagir avec les différentes équipes.
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