Mission :
Le candidat ou la candidate prendra part au projet VORTEX dont l'objectif principal est d'analyser des composés organiques volatils (COV) dans l'air expiré de patients pour développer un outil de diagnostic rapide d'infections respiratoires émergentes (virales et bactériennes). Pour ce poste, la personne recrutée travaillera sur i) la caractérisation du volatilome de souches cliniques de Legionella pneumophila isolées par un partenaire hospitalier, et ii) l'exploration du rôle de certains COV clés au cours du cycle infectieux de la bactérie. Ce deuxième axe comprend notamment une approche métabolomique chez Legionella pneumophila ainsi que l'utilisation de mutants chez cette souche.
Activités :
- Culture bactérienne (avec et sans cellules) puis mesure de COV en SPME-GC/MS
- Analyse des chromatogrammes GC et identifications des différents COV
- Création de mutants de délétion de Legionella pneumophila pour des enzymes d'intérêt
- Approche moléculaire de la réponse bactérienne à certains COV (WT et mutants) par PCR et RTqPCR
- Mise en place d'une approche métabolomique non ciblée chez Legionella pneumophila
- Présentation des résultats lors des réunions hebdomadaires
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