L'Institut Pasteur conduit des recherches biomédicales de pointe et avant-gardistes depuis plus de 130 ans.
Sur notre campus de 5 hectares en plein Paris (15è arrondissement), dans un environnement multiculturel et stimulant, 3000 personnes collaborent pour répondre aux ambitions de l'Institut Pasteur.
Le laboratoire de découverte de pathogènes a pour objectif principal de découvrir, caractériser et tester le rôle d' agents infectieux nouveaux ou inattendus dans des syndromes cliniques d'étiologie inconnue ou mal caractérisée, y compris de nouveaux agents zoonotiques.
Nous recrutons pour cette équipe un(e) Ingénieur(e) de recherche Bioinformatique. CDD de 18 mois. Salaire entre 40 et 45 000€ bruts annuels avec une première expérience confirmée ; adaptation si besoin.
MISSIONS
Vous interviendrez dans des projets de séquençage du virome ayant pour objectifs de caractériser de nouveaux pathogènes humains, ou de nouveaux virus à potentiel zoonotique, et à identifier les facteurs qui contribuent à augmenter le risque de saut d'espèce. Vous travaillerez en relations avec le personnel « wetlab » bien que vos activités se focaliseront principalement sur l'analyse de données avec l'emploi de pipelines existants, et le développement de nouvelles méthodes informatiques et statistiques adaptées au haut-débit. Les attentes seront adaptées au profil de la personne recrutée, avec évolution des activités associée à la montée en compétence.
A terme la personne recrutée aura pour objectifs à :
• Optimisation, mise au point, et veille bibliographique sur les méthodes de séquencage pour améliorer la détection de pathogènes.
• Veille bibliographique des outils informatiques d'analyse et évaluation de nouveaux outils et méthodes quand nécessaire
• Optimisation de pipelines de traitement de larges jeux de données de séquençage de virome qui seront régulièrement utilisés par le laboratoire. Cela comprend des données de métagenomique clinique (humain) et de métatranscriptomique d'espèces réservoirs ou vecteurs (chauves souris, tiques, moustiques, parasites)
• Participer à la mise au point et validation de nouveaux pipelines pour automatiser l'assemblage et l'annotation de génomes de virus nouvellement découverts.
• Réaliser ou participer à l'exploitation des données en appliquant les méthodes statistiques les plus appropriées.
• Supervision ou assistance des étudiants et post-doctorants en termes de séquençage et d'analyse de données de séquençage.
• Diffusion des bonnes pratiques en bioinformatique au sein du laboratoire
• Soutien à la collecte, la gestion et l'organisation des données au sein du laboratoire.
• Participer à la conception de projets
En cliquant sur "JE DÉPOSE MON CV", vous acceptez nos CGU et déclarez avoir pris connaissance de la politique de protection des données du site jobijoba.com.