Vos missions en quelques mots Missions : Le/la postdoctorant(e) mènera des analyses bioinformatiques et comparatives à grande échelle afin de caractériser le potentiel codant des éléments transposables (TEs) et leurs dynamiques évolutives à travers les eucaryotes. Il/elle contribuera au développement et à l’application de pipelines d’analyse en génomique et épigénomique, incluant l’exploitation de données de séquençage à haut débit et long-read. Le/la candidat(e) participera également à l’interprétation biologique des résultats, à la rédaction d’articles scientifiques, et à la diffusion des travaux dans des conférences internationales. Activités : -Réaliser et coordonner des analyses bioinformatiques et de génomique comparative dans le cadre du projet de recherche -Exploiter et interpréter des données de séquençage à haut débit et des jeux de données génomiques à grande échelle -Adapter et optimiser des pipelines et outils d’analyse pour répondre aux besoins du projet -Participer à l’intégration, à la structuration et à la valorisation scientifique des résultats produits -Contribuer aux interactions scientifiques et techniques avec les membres de l’équipe et les collaborateurs du projet Contexte de travail : Le poste s’inscrit dans le cadre d’un projet ERC visant à comprendre comment les interactions entre éléments transposables et génome hôte influencent leur succès évolutif, leur persistance et leur impact sur l’évolution des génomes (https://doi.org/10.3030/101229950) Le/la postdoctorant(e) sera intégré(e) à l’équipe « Plant Quantitative Genomics and Epigenomics » à l’Université Paris-Saclay, dans un environnement interdisciplinaire combinant génomique des populations, épigénomique, biologie computationnelle et génétique moléculaire. Le projet implique des collaborations internationales et l’accès à des ressources de calcul intensif (HPC, GPU). Profil recherché Competences : Savoirs généraux (diplôme, qualification, connaissances, langues) : -Doctorat en biologie, génomique, bioinformatique ou data science -Bonnes connaissances en génomique et biologie évolutive -Maîtrise de l’anglais scientifique (écrit et oral) -Connaissances en éléments transposables, épigénomique ou biologie des génomes Savoir-faire (expérience et compétences techniques) : -Expérience en analyse de données de séquençage (RNA-seq, WGS, WGBS ou similaires) -Compétences en programmation (Python, R, ou équivalent) -Expérience en génomique comparative ou annotation des éléments transposables appréciée -Capacité à développer et adapter des pipelines bioinformatiques -Expérience en environnement de calcul haute performance (HPC) souhaitée -Familiarité avec approches basées sur l’IA ou le calcul GPU est un plus Savoir-être (comportements et pratiques professionnelles) : -Autonomie et capacité à conduire un projet de recherche -Rigueur scientifique et esprit critique -Capacité à travailler en équipe dans un environnement interdisciplinaire -Bonnes capacités de communication scientifique -Motivation pour s’intégrer dans un projet collaboratif à long terme Contraintes et risques : Niveau d'études minimum requis Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents Spécialisation Formations générales Langues Français Seuil
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