Le Métaboscope regroupe un ensemble d'équipements d'analyse chimique mutualisés destinés à soutenir les activités de recherche et d'enseignements des laboratoires de l'institut AgES d'Avignon Université et pouvant également être accessibles à des partenaires académiques externes et privés. Elle regroupe notamment : (i) deux systèmes de chromatographie en phase gazeuse (GC-ToF, Py-GC-MS) couplée à des spectromètres de masse, (ii) deux appareils de chromatographie liquide ultra haute performance et un système de chromatographie semi-préparative couplés à des spectromètres de masse (UPLC-QToF, UPLC-DAD-TQ, Prep.-LC-DAD-Q) et (iii) un spectromètre de résonance magnétique nucléaire (RMN, 400M Hz).
Les instruments sont principalement destinés au développement d'approches métabolomiques pour l'étude des systèmes biologiques.
La plateforme est ainsi sollicitée pour divers types d'analyses :
- Analyses non-ciblées de métabolites primaires ou spécialisés, polaires ou apolaires : sucres, acides aminés, acides organiques, acides gras, terpénoïdes, alcaloïdes, composés phénoliques, phytohormones, polyamines, toxines, contaminants, colorants
- Elucidation structurale de molécules organiques ;
- Quantification de traces.
La plateforme est rattachée à la Direction d'Appui à la Recherche et à l'Innovation et ce poste d'ingénieur est financé par l'EUR IMPLANTEUS. Intervenant à l'interface entre les laboratoires de recherche et les services de l'université impliqués dans la plateforme, les entreprises du territoire et les acteurs de l'écosystème de la recherche, l'ingénieur d'étude assiste la responsable opérationnelle de la plateforme dans l'animation scientifique, la gestion opérationnelle et la valorisation auprès des acteurs de la recherche et du monde socio-économique local. Il accompagne également les étudiants de l'EUR IMPLANTEUS (Doctorants Label Implanteus, étudiants du Master MAFEN dans le cadre de leurs projets tutorés ou de stage recherche faisant appel à la plateforme) et interviendra dans son programme de formation (dispense cours CM, TD et/ou TP).
Il/elle assure le support technique/logistique des équipements et la gestion des programmations d'expériences.
Par ailleurs, l'ingénieur.e interviendra en appui scientifique et technique sur le plateau métabolomique pour développer des protocoles analytiques et de traitement des données dédiés aux approches de métabolomique ciblée et non-ciblée par spectrométrie de masse. Ayant une formation en chimie analytique ou en biochimie structurale et potentiellement doté(e) de bases en biologie végétale et/ou animale ainsi qu'en bio-informatique, il/elle est familiarisé(e) avec les techniques de préparation des échantillons, d'analyses chromatographiques et spectroscopiques, et de traitement des données. Il/elle est potentiellement capable de mener un workflow de métabolomique du design expérimental et l'échantillonnage jusqu'aux analyses statistiques avancées et à l'annotation des métabolites d'intérêt.
Activités principales:
> Activités scientifiques
- Développement de protocoles analytiques et de traitement des données dans la cadre d'approches métabolomiques, en lien avec les besoins exprimés par les chercheurs,
- Accompagnement des projets et des utilisateurs et gestion du planning d'utilisation des instruments,
- Traitement des données et rédaction de rapports,
· Préparation des échantillons et des instruments préalablement aux analyses,
- Réalisation des analyses métabolomiques,
- Organisation et participation aux actions de formation des étudiants et des personnels de recherche pour l'élaboration et la conduite des protocoles expérimentaux,
- Diffusion et valorisation des résultats sous forme de rapports, de publications et de présentations orales,
- Veille technologique et contribution à l'évolution des compétences, des protocoles et des matériels,
- Maintenance des appareillages et gestion des consommables.
>Activités de gestion et d'animation
- Assurer l'administration et l'animation scientifique de la plateforme en lien notamment avec la responsable plateforme et le Comité Scientifique de la plateforme,
-Participer au pilotage et à la gestion opérationnelle de la plateforme
- Promouvoir l'offre « plateforme » auprès du monde socio-économique
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