Ingénieur / ingénieure de recherche scientifique (h/f)

Mission :
La personne recrutée aura pour mission de participer à la coordination du flux de données planctoniques généré par des imageurs et cytomètres automatisés, depuis l'acquisition jusqu'à leur bancarisation dans les plateformes européennes dédiées. La Elle contribuera également au développement et à l'opérationnalisation de Démonstrateurs de Cas d'Usages (Demonstrator Use Cases – DUC) du projet Européen Horizons DTO-BioFlow, permettant de démontrer l'intérêt d'un flux de données harmonisé au sein du Jumeau Numérique de l'Océan (Digital Twin of the Ocean - DTO).

Activités :
• Participer à la structuration de flux complets de données, conversion des fichiers bruts, extraction d'images, harmonisation, classification, contrôle qualité et intégration dans les plateformes et/ou bases de données (EcoTaxa, EMODnet).
• Assurer la qualité, la traçabilité et la cohérence des données en appliquant les standards et vocabulaires contrôlés utilisés par les infrastructures européennes.
• Contribuer à l'amélioration des protocoles et outils de traitement, en collaboration avec les partenaires scientifiques et techniques du projet.
• Participer à l'analyse automatisée des images planctoniques (méthodes de classification supervisées, extraction de signaux).
• Réaliser une veille scientifique sur les méthodes d'imagerie, d'automatisation et d'intégration de données.
• Contribuer à la rédaction de rapports techniques, protocoles, synthèses destinés au consortium DTO-BioFlow.
• Développer, tester et documenter les scripts et outils facilitant le traitement et la mise en forme des jeux de données.
• Participer à la mise en œuvre des Démonstrateurs de Cas d'Usage, en mobilisant les données harmonisées pour l'analyse et l'évaluation des services scientifiques du DTO.
• Identifier les besoins et contraintes liés aux DUC et proposer des évolutions du flux de données pour y répondre.