Ces deux projets mobilisent à des échelles spatiales nationale et régionale des données d'abondance et de diversité microbienne ainsi que des données physicochimiques et agronomiques nécessitant d'être bancarisées et analysées pour diagnostiquer la qualité des sols.
Vous travaillerez sur les données produites dans le cadre des projets portés par l'UMR Agroécologie dans le domaine de la transition agroécologique des systèmes de culture et, plus particulièrement, sur la compréhension des principes écologiques opérant dans les agroécosystèmes. Vous aurez comme missions de :
- Mettre en place et optimiser les procédures de recueil et de contrôle des données : maintenir/faire évoluer les outils de saisie numérique (terrain, laboratoire) pour assurer la bancarisation et la qualité des données produites dans le respect des règles de gestion de la donnée (RGPD) ;
- Organiser la mise en forme, le stockage des données en s'appuyant sur des modèles de données en adéquation avec la démarche FAIR ; de mettre en place des accès sécurisés aux datasets et aux projets de l'équipe au sein d'une base de données partagée ;
- Réaliser le traitement des données en mettant en oeuvre des méthodes de traitement mathématique pour l'évaluation de la qualité écologique des sols en lien avec les pratiques agricoles adaptées à la diversité des données produites (quantitatives, qualitatives), principalement des analyses multivariées (méthodes d'ordination, classification) et des calculs automatisés d'indicateurs ;
- Assurer la maintenance des bases de données créées ;
- Diffuser et valoriser des résultats sous forme de rapports techniques/d'études ;
- Gérer et maintenir des outils informatiques partagés : gestion des outils informatiques de saisie des données au terrain et les accès sécurisés par dataset et par projet ;
- Conseiller et former aux techniques et outils développés, en priorité sur les outilsde saisie (terrain, laboratoire) permettant de bancariser des données consolidées et les approches de pré-traitement/traitement des données : analyses multivariées, calculs d'indicateurs ;
- Définir les procédures d'assurance qualité et veiller à leur mise en oeuvre ;
- Appliquer et faire appliquer les règles en vigueur de la déontologie, l'éthique, les bonnes pratiques ;
- Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité ;
- Participer à la valorisation académique des données ;
- Participer à des réseaux professionnels.
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