Contexte du recrutement et définition de poste :
Sujet : Suivis de la phénologie foliaire et de l’état sanitaire des arbres par imagerie aérienne dans une forêt urbaine.
Mots-clés : Phénologie foliaire, analyse d’image aérienne, traits fonctionnels, modélisation, changement climatique
Encadrement : Thomas Caignard (), Shannon Brandt (), Sylvain Delzon ()
Lieu : UMR BIOGECO, Allée Geoffroy Saint-Hilaire, 33615 Pessac
Contexte
La phénologie foliaire caractérise les événements saisonniers des arbres, tel que le débourrement, c’est-à-dire la date d’apparition des feuilles au printemps ou la sénescence, date de leur chute en automne. Ces évènements sont sensibles aux variations climatiques et plus spécifiquement à la température. En ce sens, ce sont des marqueurs du changement climatique, on observe par exemple un débourrement de plus en plus précoce au cours du temps en réponse à l’augmentation des températures (Vitasse et al. 2009). Ces fluctuations ont un impact à l’échelle locale et globale, influençant la composition des écosystèmes et l’interaction entre les espèces et plus largement les cycles biophysiques et biogéochimiques. Le suivi de ces événements est un enjeu majeur pour mieux comprendre les mécanismes affectant la phénologie et prédire la réponse des forêts aux changements globaux. Historiquement, ces suivis réalisés à partir d’observations sur le terrain permettent d’obtenir des données à l’échelle individuelle. Toutefois, ces notations sont soumises à un potentiel biais observateur et sont relativement chronophages lorsque que l’on suit un grand nombre d’individus (Liu et al. 2021). Ainsi, les observations par imagerie sont actuellement en plein développement et les perspectives sont multiples à travers notamment les fortes avancées réalisées grâce au développement des satellites d’observation couplé à l’intelligence artificielle (Schwartz et al. 2024). Toutefois, la résolution par imagerie satellite ne permet pas, actuellement, de faire des suivis à l’échelle de l’individu en particulier sur des forêts mélangées. L'imagerie aérienne par drone et les techniques de photogrammétrie permettent, grâce une résolution d’image au niveau cm, de faire des suivis sur des arbres individuels à l’échelle du paysage (Klosterman et Richardson, 2017).
La forêt expérimentale de l’université de Bordeaux est une forêt urbaine située en plein cœur de la métropole bordelaise. De par sa proximité avec la ville, cette forêt est confrontée à de nombreux stress biotiques et abiotiques impactant la phénologie et l’état sanitaire des arbres. Afin de quantifier les effets des variations du climat, des suivis de débourrement et de sénescence foliaire sont réalisés depuis 2022 sur une soixantaine d’individus de plusieurs espèces à partir d’observation par la jumelle et par drone. En parallèle, leur état sanitaire est estimé chaque année sur les bases d’observations.
Objectifs
L’objectif de ce travail est de calibrer les données par imagerie aérienne avec les observations de terrain afin de développer un modèle permettant d’étendre les suivis de l’avancement phénologique des arbres ainsi que leur état sanitaire sur un grand nombre d’individus. Ce stage combinera observations de terrain, analyse de données et cartographie. L’étudiant sera en charge de tester et développer les modèles de calibration, de définir des indices pour caractériser la santé des arbres et de réaliser des suivis du débourrement foliaire. Ces résultats permettront de caractériser la réponse globale de la forêt urbaine aux variations climatiques et microclimatiques. A terme, ces données permettront de calibrer et d’affiner à plus large échelle des suivis individuels par imagerie satellite. L'étudiant aura l'opportunité de collaborer et de présenter ses résultats dans des laboratoires nationaux et internationaux.
Stage à pourvoir entre février et juillet 2026.
Gratification selon lesgislation en vigueur
Envoyez votre candidature avant le 31/10/2025
Pour candidater : Envoyer un CV, une lettre de motivation aux encadrants :
Thomas Caignard (), Shannon Brandt (), Sylvain Delzon ()
Profil recherché :
Profil recherchés :
Maîtrise des outils de traitement et d'analyse d'images (idéalement appliqués à l'imagerie aérienne par drone), Notion de programmation en R et compétences en analyse statistique. Connaissances en écologie forestière
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