Chargé d’étude « bancarisation et traitement des données de captures en mer d’amphihalins (capt’mer) » (f/h)

Contexte du recrutement et définition de poste

L’Unité Patrimoine Naturel (PatriNat) - co-habilitée par le Muséum national d’Histoire naturelle (MNHN), l’Office française de la biodiversité (OFB), le Centre national de la recherche scientifique (CNRS) et l’Institut de recherche pour le développement (IRD) – a pour mission de produire une expertise scientifique et technique en faveur de la conservation de la biodiversité.


Au sein du MNHN, PatriNat est rattachée à la Direction Générale Déléguée Recherche, Expertise, Valorisation et Enseignement du Muséum (DGD REVE), et a pour objectif de fournir, en lien fort avec les activités de recherche, une expertise scientifique sur la biodiversité et géodiversité de France métropolitaine et ultra-marine, sur les thématiques terrestres et marines, pour l’environnement passé et actuel. Cette expertise et l’ingénierie associée porte sur la connaissance du patrimoine naturel, dont les systèmes d'informations et à l'application de ces connaissances pour l'appui aux politiques et programmes de conservation de la biodiversité.

CONTEXTE

Dans le cadre de la Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM), le référent amphihalins de l’équipe Expertise en Ecologie Marine de PatriNat, contribue au développement méthodologique du programme de surveillance et à l’évaluation du Bon Etat Ecologique (BEE) et des Objectifs Environnementaux (OE) des poissons côtiers à l’échelle nationale métropolitaine. Pour les espèces amphihalines, il travaille en étroite collaboration avec le pôle de recherche et de développement OFB, INRAE, Institut Agro et UPPA sur les poissons migrateurs dans leurs environnementaux (Pôle R&D MIAME). Le pôle est en effet responsable au niveau national du suivi des espèces amphihalines (anguilles, saumons, truites de mer) dans le cadre du Data Collection Framework (DCF), règlement européen qui encadre la collecte, la gestion et la mise à disposition des données pour les différents groupes scientifiques qui fournissent un avis sur l’état des stocks de poissons.

Les Objectifs Environnementaux (OE) de la DCSMM visent à ramener les pressions exercées par les activités humaines sur le milieu marin et les différentes composantes de biodiversité à des niveaux compatibles avec le maintien du bon état écologique (BEE) des eaux marines. La pression de pêche étant une des pressions impactant le BEE des espèces amphihalines, une quantification des prélèvements par la pêcherie professionnelle est nécessaire pour renseigner l’OE D01-PC-OE03-ind1 de la DCSMM. Cet OE consiste à évaluer « le nombre de captures d’amphihalins déclarées/an par les pêcheurs professionnels dans les estuaires, les panaches estuariens et les graux à l’aval de la limite la salure des eaux (LSE) ». Pour l’anguille, la cible à atteindre est fixée à « -60% de mortalité par pêche par rapport à une période de référence (2004-2008) qui correspond à la mise en place du Plan de Gestion Anguille (PGA ) ». Pour les autres espèces (esturgeon européen, grande alose et aloses feintes atlantiques et méditerranéennes, lamproies marines et fluviatiles, saumon atlantique et truite de mer), la cible fixée est « un maintien ou une réduction de cette mortalité par pêche », la période de référence restant à définir.

DESCRIPTION DES MISSIONS

Dans ce contexte, le chargé d’étude recruté travaillera, en collaboration avec les agents du pole MIAME spécialisés sur cette thématique, sur les données de déclarations de captures des espèces amphihalines des marins pêcheurs ainsi que sur un ensemble de jeux de données (bases SACROIS-SACAPT-VisioCApture) permettant la mise en qualité de ces données. Il se verra confier plusieurs missions:

1) Finaliser la mise en place des procédures automatiques/semi-automatiques permettant l’intégration et la qualification des données de déclarations des marins pêcheurs dans la base de données Postgresql existante du pôle R&D MIAME

2) Analyser, pour chaque espèce et chaque sous-région marine (Manche/Mer du Nord, Mers Celtiques, Golfe de Gascogne et Méditerranée Occidentale), les données de captures et déterminer les périodes de référence les plus pertinentes en fonction de la qualité des données disponibles

3) Calculer les indicateurs OE

4) Rédiger un rapport final présentant les méthodes mises en place et les principaux résultats et permettant un rapportage au titre de la DCSMM et de la DCF


Profil recherché

CONDITIONS ADMINISTRATIVES REQUISES

Au minimum Ingénieur ou Master de niveau Bac+5 ou docteur en écologie et/ou analyse de données

QUALIFICATIONS REQUISES

· Compétences relatives aux outils et systèmes de bancarisation et de traitement des données (Postgresql, R,…)

· Fortes aptitudes à travailler aussi bien en équipe qu’en autonomie

· Connaissances en écologie aquatique et idéalement sur les poissons migrateurs

· Rigueur scientifique

· Capacité rédactionnelle

· Une expérience dans le contexte des pêcheries professionnelles serait un plus


Information(s) complémentaire(s)

Venez rejoindre un établissement chargé d’histoire, engagé dans la société, en pleine évolution, à la renommée nationale et internationale. Riche d’une grande variété de métiers et d’activités, le Muséum vous propose d’intégrer des équipes à taille humaine dans un cadre de travail agréable et un environnement stimulant.


MODALITÉS DE RECRUTEMENT

Type de contrat : Contrat à durée déterminée de droit public

Durée : 6 mois. Fin de contrat prévu au 31.12.2026 dernier délai, avec reconduction possible en 2027

Rémunération : En fonction des grilles de rémunération et du profil du candidat retenu

Date de prise de fonction : Entre le 1er Juin et 31 Juillet 2026

Résidence administrative : Candidat hébergé avec convention d’accueil à l’INRAE (U3E) de Rennes

AVANTAGES

· Accès illimité aux sites du Muséum

· Télétravail jusqu’à deux jours par semaine selon cycle de travail choisi

· Accès à un comité social et une association sportive et culturelle

· Prise en charge partielle de votre mutuelle (selon conditions)

· Remboursement de 75% des frais de transport en commun ou forfait mobilité durable (vélo ou covoiturage)

PROCÉDURE DE RECRUTEMENT

Le dossier de candidature est à envoyer jusqu’au 15 avril 2026

Ce dossier comprendra :

- une lettre de motivation

- un curriculum vitae détaillé et tous les travaux susceptibles d'éclairer le jury ;