Ingénieur bioinformaticien (h/f)

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Informations sur le poste

* Fonction publique : Fonction publique de l'État
* Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
* Nature de l’emploi : Emploi ouvert uniquement aux contractuels
* Nature du contrat : Non renseigné
* Expérience souhaitée : Non renseigné


Rémunération

Fourchette indicative pour les contractuels à partir de 2 491 € brut / mois selon expérience. Pour les fonctionnaires, non renseignée.

* Catégorie : Catégorie A (cadre)
* Management : Non renseigné
* Télétravail possible : Non renseigné


Mission

L'agent sera recruté comme ingénieur d'étude pour réaliser des analyses bioinformatiques de 3 essais cliniques en oncologie. Les analyses viseront à identifier des biomarqueurs de réponse et/ou d'efficacité, en utilisant des échantillons avant/après traitement et le statut de réponse du patient.


Activités

* Analyse de données RNAseq issues de cohortes de patients issus d’essais cliniques, y compris single-cell RNAseq et analyses transcriptomiques spatiales.
* Analyse bioinformatique avec R, Python et Bash (cluster de calcul).
* Collaboration avec biologistes et cliniciens pour interpréter les résultats et rédiger des rapports et publications.
* Participation à la communication scientifique, notamment présentations orales et rédaction d’articles.
* Veille technologique sur les méthodes d’analyse transcriptomique.


Contexte de travail

Le Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (CRCL) est un centre de renommée internationale dédié à la recherche en oncologie. Composé de plus de 600 chercheurs et cliniciens, il se consacre à comprendre le cancer et à développer de nouvelles stratégies thérapeutiques. Vous travaillerez dans un environnement scientifique international, intégré à l’équipe "Apoptose, Cancer et Développement".


Profil recherché

* Formation en bioinformatique, biologie computationnelle, biostatistiques ou domaine équivalent.
* Maîtrise des langages R et Python pour le traitement et l’analyse de données transcriptomiques.
* Connaissance des méthodes d’analyse RNAseq, single-cell RNAseq et analyses transcriptomiques spatiales, même à un niveau débutant ou intermédiaire.
* Bonnes capacités de communication orale et écrite, aisance pour présenter des résultats en congrès et rédiger des publications.
* Capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire, rigueur et autonomie.


Niveau d'études minimum requis

* Niveau : Licence ou diplôme équivalent
* Spécialisation : Sciences naturelles (biologie-géologie)

Le CNRS est l’une des plus importantes institutions publiques mondiales, avec plus de 33 000 employés, dont plus de 16 000 chercheurs et autant d’ingénieurs et techniciens, en partenariat avec universités et grandes écoles, explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

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