H/f, offre de post-doc sur : spécialiste du microbiome et approches metabarcoding

Informations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR5300-PHIHEE-001 Date de début de diffusion 10/04/2026 Date de parution 26/04/2026 Date de fin de diffusion 01/05/2026 Intitulé long de l'offre H/F, Offre de post-doc sur : Spécialiste du microbiome et approches metabarcoding Date limite de candidature 01/05/2026 Nature du contrat CDD d'1 an Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Chercheuse / Chercheur Statut du poste Vacant Intitulé du poste H/F, Offre de post-doc sur : Spécialiste du microbiome et approches metabarcoding Descriptif de l'employeur Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique. Description du poste Missions : Le CRBE Centre de Recherche sur la Biodiversité et l’environnement, est une unité mixte de recherche (UMR5300) dont les thématiques scientifiques s’articulent autour de l’influence des changements environnementaux et de leurs interactions avec la terre vivante, et les rétroactions des systèmes socio-écologiques sur ces changements. La personne travaillera en collaboration avec Philipp Heeb & Joël White en collaboration avec une thésarde et aura pour mission d’analyser des données de séquençage issues de projets pluriannuels et à large échelle afin d’examiner les facteurs écologiques et phénotypiques qui façonnent le microbiote intestinal des oiseaux. Elle effectuera en outre un travail d’analyses moléculaires et de traitement bioinformatique sur des données de metabarcoding alimentaire (projet ANR Copa-Co) Activités : - Analyses statistiques et approches multivariées sur données de metabarcoding 16S - Rédaction d’articles scientifiques et communications - Analyses en biologie moléculaire (Extraction, PCR, préparation de librairies et séquençage) sur ADN fécal et optimisation des protocoles - Traitement bioinformatique des données de metabarcoding alimentaire Contexte de travail : Nos recherches visent à mieux comprendre le rôle du microbiote intestinal dans la réponse des organismes face aux perturbations anthropiques de leur environnement. Nous explorons en particulier l’impact de l’urbanisation sur les interactions hôte-microbiote chez les mésanges. Télétravail possible sur une journée flottante par semaine sous condition de l’autonomie de l’agent et de la déclaration via les outils de la tutelle Conditions particulières d'exercice Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche. Descriptif du profil recherché Competences : - Compétences en sequençage en approche par metabarcoding - Compétences en bioinformatique - Compétences en analyses statistiques multivariées - Compétences rédactionnelles et valorisation des données - Maitrise des techniques de biologie moléculaire - Proactivité, autonomie et rigueur - Capacité à travailler en équipe Contraintes et risques : Le travail consistera principalement à réaliser des analyses en bioinformatique au sein des ressources informatiques et plateforme B2M du CRBE. La possibilité de participer au travail de terrain sera examinée au cours du contrat. Temps plein Oui Rémunération contractuels (en € brut/an) entre 3041€ et 4395€ brut mensuel selon expérience Localisation du poste Europe, France, Occitanie, Haute Garonne (31) Géolocalisation du poste TOULOUSE Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 31062 TOULOUSE (France) Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents Spécialisation Formations générales Langues Français (Seuil)