Étudier la diversité génétique, épigénétique et phénotypique des infections anogénitales par des papillomavirus humains, et établir des connexions avec la présentation clinique et la progression de l’infection.
Activités
-Biologie moléculaire et cellulaire dans environnement confiné L2.
-Biochimie des protéines et des acides nucléiques.
-Génotypage et épigénotypage de HPVs.
-Dessin et réalisation d’expériences, élaboration et mise au point de protocoles, interprétation des résultats, analyse statistique de données, génération de rapports; si nécessaire, développement de méthodologies.
-Gestion logistique du laboratoire (suivie des stocks, commandes, entretien).
-Formation et encadrement techniques des utilisateurs. Élaboration et mise au point de protocoles.
-Lecture régulière d’articles et de protocoles. Rédaction d’articles scientifiques et de rapports techniques.
-Contribution à la vie scientifique de l’équipe. Formation et encadrement d’étudiants. Contribution à la formation et à l’encadrement technique d’autres utilisateurs des techniques.
-Participation à des conférences nationales et/ou internationales.
Compétences
-(RT)-qPCR; western blot; quantification de DNA, RNA et protéines; préparation d'échantillons pour NGS et pour protéomique
-techniques de microbiologie pour la biologie moléculaire en biosécurité 2; clonage, transformation, plasmid prep
-culture cellulaire en biosécurité 2; transfection, cytométrie, xcelligence
-génotypage et épigénotypage de papillomavirus humains
-gestion de séquences et plasmides
-analyse basique de séquences
-analyses statistiques
-anglais lu/écrit/parlé
Contexte de travail
La personne recrutée travaillera dans l’équipe VIRONOISE, laboratoire MIVEGEC, et développera aussi des activités dans les laboratoires des équipes de Vincent FOULOGNE et de Nathalie BOULLE au CHU Montpellier. Les activités seront en relation avec le projet MET-AIMA-CC, financé par l’ANRS, pour étudier la méthylation des gènes humains et des papillomavirus humains comme marqueur de progression des lésions cervicales de haut grade chez les femmes vivant avec infection chronique par VIH.
La personne recrutée travaillera dans l’équipe VIRONOISE, laboratoire MIVEGEC, et développera aussi des activités dans les laboratoires des équipes de Vincent FOULOGNE et de Nathalie BOULLE au CHU Montpellier. Les activités seront en relation avec le projet MET-AIMA-CC, financé par l’ANRS, pour étudier la méthylation des gènes humains et des papillomavirus humains comme marqueur de progression des lésions cervicales de haut grade chez les femmes vivant avec infection chronique par VIH.
Contraintes et risques
Horaires de bureau sauf exceptions par nature du dessin expérimental exceptionnelle (par exemple, entretien de cultures cellulaires) qui peuvent impliquer du temps de travail en jours fériés ou en fin de semaine. Travail en niveau de biosécurité 2.
Horaires de bureau sauf exceptions par nature du dessin expérimental exceptionnelle (par exemple, entretien de cultures cellulaires) qui peuvent impliquer du temps de travail en jours fériés ou en fin de semaine. Travail en niveau de biosécurité 2.
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