Doctorat (h/f) - colonisation bactérienne des surfaces en présence de stress mécanique

Informations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR5588-DELDEB-007 Date de début de diffusion 29/04/2026 Date de parution 01/05/2026 Date de fin de diffusion 20/05/2026 Intitulé long de l'offre Doctorat (H/F) - Colonisation bactérienne des surfaces en présence de stress mécanique Date limite de candidature 20/05/2026 Nature du contrat CDD de 3 ans Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Chercheuse / Chercheur Statut du poste Vacant Intitulé du poste Doctorat (H/F) - Colonisation bactérienne des surfaces en présence de stress mécanique Descriptif de l'employeur Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique. Description du poste Sujet de thèse : La propagation de micro-organismes pathogènes à partir de la surface d'équipements contaminés constitue un enjeu majeur de santé publique, à l'origine d'infections nosocomiales ou de contaminations alimentaires. La contamination de surface par des bactéries implique la sécrétion d'une matrice extracellulaire qui accroît considérablement leur résistance aux agressions chimiques, pharmaceutiques ou mécaniques. Cependant, cette production de matrice et l'adhérence sur des surfaces solides qui en résulte à la surface limitent également la capacité des bactéries à explorer largement leur environnement, conférant un avantage adaptatif aux espèces ayant des interactions de surface plus transitoires. La compétition et la coopération entre différentes souches ou espèces dépendent donc fortement de leur stratégie d'exploration de surface, mais aussi des contraintes physiques externes auxquelles elles peuvent être confrontées, soit de manière continue sous l'effet d'un écoulement, soit lors d'événements catastrophiques tels que le démouillage de la surface. Ce projet de doctorat vise à étudier expérimentalement comment la décontamination de surface induite par le démouillage peut influencer l'équilibre entre différentes bactéries en compétition pour la colonisation de surface, et comment des effets coopératifs peuvent survenir grâce au partage des composants de la matrice sécrétée. Le candidat retenu mettra à profit le savoir-faire expérimental des équipes impliquées en microbiologie, microfluidique, microscopie et analyse d'images afin d'étudier le rôle de la motilité et de la matrice extracellulaire dans la compétition bactérienne pour la colonisation des surfaces, ainsi que la manière dont cette compétition est affectée par des événements catastrophiques tels que le démouillage de la surface. Il concevra et réalisera des expériences modèles visant à visualiser l'adhérence bactérienne, la formation de colonies, ainsi que l'élimination ou la réorganisation subséquente des bactéries lors du passage d'une bulle dans un canal d'écoulement. Dans un deuxième temps, il étudiera également si des sous-populations de bactéries présentant des phénotypes particuliers sont sélectionnées lors du passage de la bulle et du séchage, et si cette sélection influence l'équilibre écologique à la surface. Enfin, il collaborera avec une équipe de physiciens et de théoriciens de la matière molle afin de modéliser ses données expérimentales. Contexte : ENVIRONNEMENT DE TRAVAIL Le projet est une collaboration entre les équipes du Dr Delphine Débarre au Laboratoire de Physique Interdisciplinaire (LIPhy) de Grenoble et du Dr Sigolène Lecuyer au Laboratoire de Physique de l’ENS Lyon. Vous travaillerez principalement à Grenoble, avec des missions à Lyon et dans d’autres laboratoires du réseau. Grenoble est la plus grande ville des Alpes françaises et l’un des pôles de recherche les plus renommés de France, offrant Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr Conditions particulières d'exercice Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche. Descriptif du profil recherché Contraintes et risques : Le système modèle bactérien est le pathogène opportuniste P. aeruginosa, qui peut poser des problèmes de santé aux personnes immunodéprimées ou en cas de grossesse. Dans ces cas, des ajustements seront discutés pour atténuer les risques. Dans tous les cas, une formation appropriée en santé et sécurité sera dispensée. Temps plein Oui Rémunération contractuels (en € brut/an) La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel Localisation du poste Europe, France, Auvergne-Rhône-Alpes, Isère (38) Géolocalisation du poste ST MARTIN D HERES Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 38402 ST MARTIN D HERES (France) Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 7 Master/diplômes équivalents Spécialisation Formations générales Langues Français (Seuil)