Ingénieur de recherche « génotypage des pathogènes » h/f

Référence

2024-13649

Date de début de diffusion

10/09/2024

Date de parution

10/09/2024

Description du poste

Métier

Autres domaines Ingénierie de la recherche - Ingénieur de recherche

Intitulé du poste

Ingénieur de recherche « Génotypage des pathogènes » H/F

Missions/Activités

L'ERI est constituée d'une équipe d'environ 25 personnes comprenant la CIBU (Cellule d'Intervention Biologique d'Urgence) qui se compose de 3 pôles d'activité (Pôle d'Identification Virale, Pôle d'Identification Bactérienne et Pôle de Génotypage des Pathogènes) et le CNR Hantavirus. La principale mission de la CIBU est la réponse aux Urgence Biologiques Spécialisées. Ces urgences sont déclenchées en cas de bioterrorisme, d'épidémies, d'accidents ou d'attentats utilisant des armes biologiques qui peuvent mettre en danger la santé publique.

Activités principales :
- Répondre aux urgences biologiques demandées par la DGS sur le versant séquençage;
- Prendre en charge la réalisation technique et analytique des projets scientifiques collaboratifs menés par l'entité (évolution des agents pathogènes émergents et/ou épidémiques, métagénomique infectieuse, génomique comparative...) ;
- Prendre en charge le développement de nouvelles méthodes de détection/caractérisation moléculaire des agents pathogènes émergents et/ou épidémiques ;
- Prendre en charge la mise au point de nouvelles méthodologies ;
- Participer aux enseignements et formations dispensés par l'entité (y compris à l'étranger, notamment dans le réseau international des Instituts Pasteur) ;
- Rendre compte de l'avancement des études réalisées au travers de bilans et de réunions régulières auprès de ses collègues et supérieurs hiérarchiques ;
- Présenter en interne et en externe les études réalisées dans le cadre des projets ;
- Participer à la rédaction des articles scientifiques ;
- Participer à l'entretien des équipements de l'entité ;
- Participer au système qualité par des actions spécifiques ainsi qu'à la rédaction, vérification, révision et application des procédures et modes opératoires ;
- Participer aux missions de terrain pour du diagnostic d'urgence lors d'épidémies/pandémies, en France et à l'étranger, notamment en laboratoire mobile

Activités associées :
- Effectuer les demandes d'achat, en fonction de la gestion des stocks
- Réaliser l'habilitation des stagiaires et étudiants aux techniques nécessaires
- Participer aux réunions internes de l'entité
- Participer aux réunions (internes et externes) concernant les projets collaboratifs
- Présenter les résultats obtenus en interne et en externe (congrès…)
- Rédiger en alternance avec les autres de l'équipe les comptes rendus de réunions
- Assurer la gestion des équipements avec ses collègues
- Participer aux interviews des médias


L'engagement ferme est subordonné à l'obtention de l'habilitation au titre de la protection du secret de la défense nationale
+ Habilitation MOT, ZRR

Travail le WE et jours fériés régulier
+ Missions à l'étranger, dont missions en laboratoire mobile
+ Participer au système d'astreintes microbiologiques (24/24, 7/7) de la CIBU (environ 8 semaines par an)

Profil

Diplôme de master 2 ou école d'ingénieur.
Expérience reprenant les capacités techniques ci-dessous

Compétences techniques :
- Maitrise des techniques de séquençage Sanger et à haut débit (Illumina et Nanopore)
- Maitrise des outils bioinformatiques utilisés dans l'analyse des données de séquençage à haut débit
- Maitrise des techniques de biologie moléculaire appliquées à la microbiologie (PCR, qPCR, extraction, etc)
- Maitrise des outils bioinformatiques généralistes et ceux plus spécifiques aux analyses de séquences (MEGA, CLC, ..)
- Maitrise d'un langage de programmation (R, python, C, …)
- Travail en laboratoire confiné (L2, L3)
- Maitrise de l'anglais
- Maitrise des outils informatiques de bureautique

Compétences personnelles :
- Aisance avec la manipulation d'agents infectieux de Classe 2 à Classe 4
- Rigueur
- Autonomie
- Souplesse
- Efficacité dans l'urgence
- Sens de l'organisation
- Savoir rendre compte
- Capacité de rédaction
- Travail en équipe
- Esprit d'initiative
- Bonne gestion des priorités et réactivité dans le traitement des projets
- Sens relationnel avec les collègues de l'unité et les équipes partenaires

Type de contrat

Contrat à durée indéterminée

Temps de travail

Temps plein

Travail le we

Oui

Astreintes

Oui

Déplacements

International

Critères candidat

Niveau d'années d'expérience souhaitée

0 à 2 ans

Niveau d'étude souhaité

Bac + 5

Certification ou habilitation requise

Aucune

Localisation du poste

Localisation du poste

France, Paris

Demandeur

Poste à pourvoir le

01/12/2024