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Postdoctorant-e en modélisation des interactions plante-microbiote

Nice
27 436 € par an
Publiée le Il y a 4 h
Description de l'offre

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France.INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.


Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli-e au sein de au sein de l’UMR « Institut Sophia Agrobriotech» (ISA). Situé à l'interface entre l'environnement et l'agriculture, ses principaux thèmes de recherche concernent l'étude des interactions entre les plantes, les agents pathogènes et les symbiotes, ainsi que leur dynamique dans le temps et l'espace. Le post-doctorant rejoindra l'équipe M2P2 qui développe des approches théoriques pour élucider le fonctionnement des agroécosystèmes et concevoir de nouvelles méthodes de protection des plantes. Le post-doctorant travaillera en étroite collaboration avec l'équipe MACBES (Inria, INRAE, CNRS et Université Côte d'Azur), ainsi qu'avec Simon Labarthe (INRAE/Inria, équipe PLEIADE), basé à Bordeaux.

Contexte scientifique: Les communautés microbiennes du sol sont une composante essentielle de la croissance et de la santé des plantes, assurant des fonctions de bio-défense, de nutrition et de stimulation. La composition du microbiote végétale (et par conséquent les fonctions qu'il peut remplir) est le résultat d'interactions complexes entre l'hôte, les microbes et l'environnement.

Au niveau des racines, les plantes exsudent dans la rhizosphère une vaste gamme de composés. Ces éléments sont considérés comme des ressources et des signaux chimiques susceptibles de stimuler ou d'inhiber la croissance de micro-organismes spécifiques. En conditions de stress, les plantes pourraient ainsi modifier leurs schémas d'exsudation, afin de faciliter le recrutement de micro-organismes bénéfiques et minimiser les dommages causés par le stress.

L'objectif de ce post-doctorat est d'étudier l'interaction entre les exsudats végétaux et la composition des communautés via une approche de modélisation reliant explicitement physiologie végétale et dynamique des populations microbiennes. Le ou la candidat.e sélectionné.e bénéficiera des données disponibles dans le laboratoire, incluant le phénotypage des plantes (croissance, photosynthèse, transpiration, etc.), la métabolomique des exsudats racinaires et le comptage des micro-organismes du sol, dans des conditions normales et de stress.

Vous serez plus particulièrement en charge de:

* affiner la description de la dynamique d'exsudation dans un modèle existant de plante, sur la base des données disponibles
* développer un modèle phénoménologique de la communauté microbienne, en conditions contrôlées et de stress
* analyser la dynamique du système couplé et étudier l'impact de la physiologie végétale (photosynthèse, croissance, exsudation, etc.) sur l'abondance microbienne et la composition de la communauté.

Conditions particulières d’activité: temps plein. Vous partagerez votre temps entre l’équipe M2P2 et l’équipe Inria MACBES.


Formations et compétences recherchées

Doctorat
* Formation recommandée : doctorat en mathématiques appliquées ou en écologie théorique.
* Compétences requises : expérience dans les systèmes dynamiques, l’estimation des paramètres, l'analyse de données, la programmation.
* Compétences souhaitées : une première expérience dans les mathématiques appliquées aux sciences de la vie sera un atout majeur


Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez(selon le type de contrat et sa durée) :

- jusqu'à30 jours de congés+ 15 RTTpar an (pour un temps plein)
- d'un soutienà la parentalité : CESUgarded'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences: formation, conseilen orientation professionnelle ;
- d'un accompagnementsocial : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestationsvacancesetloisirs :chèque-vacances,hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activitéssportivesetculturelles ;
- d'unerestaurationcollective.


Modalités pour postuler

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Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publiquenotamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques.> En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr

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