L'HolobiomicsLab de l'Institut de Chimie de Nice (ICN), coordonné par le Dr Louis-Félix Nothias, recherche un(e) ingénieur(e) pour developper des méthodes analytique en métabolomique clinique et exposomique. Le poste s'inscrit dans le cadre d'un contrat de recherche collaboratif avec TechInCare, une start-up deep-tech spécialisée dans les applications multi-omiques pour la médecine de précision.
L'ingénieur(e) recruté(e) sera responsable du développement et de la mise en œuvre de workflows analytiques robustes pour les analyses LC-MS/MS et GC-MS d'échantillons cliniques, avec un accent particulier sur la préparation automatisée des échantillons et les méthodologies d'extraction en phase solide (SPE) en ligne. Ce poste offre l'opportunité de travailler à l'interface de la recherche académique et des applications cliniques, contribuant à des approches métabolomiques innovantes avec un impact translationnel direct.
Activités
1. Développement et optimisation de méthodes
- Concevoir et mettre en œuvre des protocoles automatisés d'extraction d'échantillons pour biofluides et tissus afin d'améliorer la reproductibilité et le débit analytique
- Développer et optimiser l'extraction en phase solide (SPE) en ligne couplée à la LC-MS/MS pour une sensibilité et sélectivité accrues
- Établir des méthodes chromatographiques incluant : (i) Chromatographie liquide en phase inverse (RP-LC). (ii) Chromatographie d'interaction hydrophile (HILIC) ou mixed-mode chromatograhy. (iii) Chromatographie en mode mixte
- Optimiser les paramètres de spectrométrie de masse pour les analyses métabolomiques ciblées et non ciblées
2. Instrumentation et contrôle qualité
- Opérer, maintenir et dépanner les instruments LC-MS/MS et GC-MS (incluant les systèmes Orbitrap)
- Implémenter et maintenir des procédures rigoureuses de contrôle qualité assurant la reproductibilité des données
- Effectuer la calibration de routine et la maintenance préventive des instruments analytiques. Ainsi que le suivi dans le temps des performances.
- Développer et valider des procédures opératoires standard (SOP) pour l'analyse d'échantillons cliniques.
3. Traitement des échantillons et analyse des données
- Exécuter des workflows complets de préparation d'échantillons utilisant des systèmes automatisés de manipulation de liquides
- Maintenir une documentation détaillée sur cahier de laboratoire numérique du développement de méthodes et des protocoles expérimentaux
- Assurer la conformité aux normes de qualité du laboratoire et aux protocoles de gestion des données
4. Activités de recherche collaborative
- Interagir avec des équipes interdisciplinaires incluant chimiste, cliniciens, biologistes et informaticiens
- Contribuer aux publications scientifiques et présenter les résultats lors des réunions d'équipe
- Participer aux activités de formation des étudiants et jeunes chercheurs sur les techniques analytiques
Compétences
Compétences techniques
- Diplôme en chimie analytique, biochimie ou domaine connexe
- Expérience pratique en préparation d'échantillons pour spectrométrie de masse (SPE, extraction liquide-liquide)
- Connaissance de l'instrumentation LC-MS/MS et/ou GC-MS
- Expérience ou fort intérêt pour les systèmes automatisés de préparation d'échantillons et méthodologies SPE en ligne
- Maîtrise des principes chromatographiques et des logiciels de traitement de données métabolomiques
- Intérêt pour les applications biomédicales ou cliniques
Compétences transversales
- Rigueur organisationnelle et capacité à gérer plusieurs workflows analytiques
- Autonomie et aptitude au travail en équipe multidisciplinaire
- Bonnes compétences en communication (anglais écrit/oral)
- Capacités de résolution de problèmes et dépannage technique
Contexte de travail
L'Institut de Chimie de Nice (ICN) offre un environnement de recherche interdisciplinaire avec accès à des installations de pointe, notamment un Orbitrap IQ-X et des systèmes automatisés de préparation d'échantillons.
Le/la candidat(e) rejoindra l'HolobiomicsLab dans le cadre d'un contrat de recherche avec TechInCare, développant des méthodologies analytiques innovantes pour la métabolomique clinique et l'exposomique. Le poste offre l'opportunité de maîtriser des techniques de pointe (workflows SPE-LC-MS/MS en ligne) tout en contribuant à des projets à pertinence clinique directe, avec accès à des formations et collaborations internationales.
L'Institut de Chimie de Nice (ICN) offre un environnement de recherche interdisciplinaire avec accès à des installations de pointe, notamment un Orbitrap IQ-X et des systèmes automatisés de préparation d'échantillons.
Le/la candidat(e) rejoindra l'HolobiomicsLab dans le cadre d'un contrat de recherche avec TechInCare, développant des méthodologies analytiques innovantes pour la métabolomique clinique et l'exposomique. Le poste offre l'opportunité de maîtriser des techniques de pointe (workflows SPE-LC-MS/MS en ligne) tout en contribuant à des projets à pertinence clinique directe, avec accès à des formations et collaborations internationales.
Contraintes et risques
- Protocoles analytiques complexes : Développement de méthodes avancées nécessitant rigueur expérimentale et résolution rapide de problèmes techniques
- Exposition chimique : Utilisation de solvants organiques imposant le respect strict des protocoles de sécurité et port obligatoire des EPI
- Échantillons biologiques : Respect des réglementations de biosécurité pour l'analyse d'échantillons cliniques
- Gestion de projet : Coordination avec TechInCare nécessitant respect des livrables et gestion efficace du temps
- Déplacements occasionnels en France et Europe pour réunions et conférences
- Protocoles analytiques complexes : Développement de méthodes avancées nécessitant rigueur expérimentale et résolution rapide de problèmes techniques
- Exposition chimique : Utilisation de solvants organiques imposant le respect strict des protocoles de sécurité et port obligatoire des EPI
- Échantillons biologiques : Respect des réglementations de biosécurité pour l'analyse d'échantillons cliniques
- Gestion de projet : Coordination avec TechInCare nécessitant respect des livrables et gestion efficace du temps
- Déplacements occasionnels en France et Europe pour réunions et conférences
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