Informations générales
Réservé aux agents CNRS (fonctionnaires et CDI) et aux fonctionnaires et CDI de droit public
Intitulé de l'offre : Assistant-e ingénieur-e en études d'environnements géo-naturels et anthropisés H/F
Référence : UMR5805-MOBINT-O58007
Lieu de travail : PESSAC
Institut : INSU - Institut national des sciences de l'univers
Date de publication : mercredi 30 avril 2025
Session : Campagne Printemps 2025
Groupe de Fonction : AIG1
BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Assistant-e ingénieur-e en études d'environnements géo-naturels et anthropisés
Missions
Au sein de la plateforme biodiversité de l'UMR EPOC, l' ingénieur sera chargé.e de
1/ l'identification du microphytoplancton et du microphytobenthos,
2/ l'analyse automatisée d'images de phytoplancton et leur bancarisation;
3/ l'appui aux missions d'échantillonnage du microphytbenthos et du phytoplancton et
4/ la réalisation des mesures physico-chimiques de routine associées à ces organismes
Activités
-Identification et dénombrement des organismes phytoplanctoniques et microphytobenthiques par microscopie optique et par microscopie électronique à balayage.
-Préparation des échantillons de phytoplancton en vue de leur analyse (filtration, extraction,
-Préparation des échantillons de microphytobenthos en vue de leur analyse (extraction,
-Réalisation de mesures automatisées du microphytoplancton (type Flowcam ou PlanktoScope)
-Traitement des images de phytoplancton par EcoTaxa
-Réalisation des mesures de routine en écologie du phytoplancton (turbidité, fluorescence, dosage chlorophylle) et du microphytobenthos
-Maintenance, déploiement et maniement de capteurs in situ, à la fois dans la colonne d'eau mais aussi au niveau du sédiment
-Appuis aux missions terrain pour la collecte du microphytobenhtos et du phytoplancton incluant, entre autres, celles du Service National d'Observation (SNO) PHYTOBS
-Validation de données suivant démarche qualité de type SNO et bancarisation des données
Compétences
Savoirs :
- Taxinomie du (micro-)phytoplancton et du microphytobenthos marin,
- Biologie et Ecologie marine, Analyse d'image, Réglementation en matière d'hygiène et de sécurité,
- Démarche qualité et bonnes pratiques de laboratoire appliquées aux techniques utilisées en taxinomie,
- Techniques d'analyses physicochimiques relatives aux organismes photosynthétiques (dosage Chlorophylle, mesures des teneurs en MES des ,
- Démarche qualité appliquée au cycle de vie de la donnée,
- Langue anglaise : B1.
Savoir-faire :
- Identification du (micro-)phytoplancton, Identification du microphytobenthos,
- Maîtrise des techniques de fixation et d'extraction du phytoplancton,
- Maîtrise des techniques de fixation et d'extraction du microphytobenthos,
- Maîtrise des techniques d'acquisition d'image (Flowcam/Planktoscope, optionnellement, Zooscan),
- Maîtrise des outils informatiques d'analyse d'images (type EcoTaxa),maîtrise des techniques d'analyse des paramètres physico-chimique de routine (dosages de chlorophylle, teneur en MES, pH, - Permis B.
Savoir-être :
- être capable de transmettre des connaissances et de travailler en interaction avec les responsables de programmes de recherche et de services d'observation.
Contexte de travail
La personne recrutée sera affectée au sein de l'Unité Mixte de Recherche EPOC (Environnements, Paléoenvironnements Océaniques et Continentaux). Membre de l'équipe de recherche ECOBIOC (Ecologie et Biogéochimie des systèmes Océaniques et Continentaux), elle sera positionnée sur le site de la station marine d'Arcachon au sein de la Plateforme Biodiversité. Son activité consistera principalement, en association avec le responsable scientifique de cette plateforme biodiversité et la scientifique spécialiste du volet phytoplancton au sein de cette plateforme, en l'observation et le dénombrement de microalgues phytoplanctoniques et phytobenthiques sous microscope, microscope inversé et/ou loupe binoculaire. Le profil de poste inclue des embarquements réguliers d'une durée d'une demi-journée sur le navire océanographique Planula IV (rythme bimensuel, durée 1/2 journée) mais peut, en fonction des programmes, impliquer des missions plus longues, sur d'autres navires côtiers voire hauturiers. Des missions terrains sur l'estran, souvent très envasé, avec ou sans embarquement, sont à prévoir pour les travaux en lien avec le microphytobenthos.
L' ingénieur apportera ainsi un support technique aux recherches réalisées au sein de l'équipe sur l'écologie des organismes/communautés benthiques et planctoniques. Elle/Il apportera également un support technique au service d'observation national (SNO) PHYTOBS de l'Infrastructure de Recherche ILICO.
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