Ingénieur d’étude bio-informaticien h/f en épidémiologie des eaux usées

Informations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UPR9002-OLIROH-009 Date de début de diffusion 16/06/2026 Date de parution 17/06/2026 Date de fin de diffusion 07/07/2026 Intitulé long de l'offre Ingénieur d’étude bio-informaticien H/F en épidémiologie des eaux usées Date limite de candidature 07/07/2026 Nature du contrat CDD de 2 ans Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques Statut du poste Vacant Intitulé du poste Ingénieur d’étude bio-informaticien H/F en épidémiologie des eaux usées Descriptif de l'employeur Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique. Description du poste Missions : L'ingénieur d'étude (H/F) intègrera l'équipe de virologie moléculaire de l'UMR 9002 du CNRS localisée à l'IUT Louis Pasteur. Il/elle contribuera au développement de techniques de suivi, d’identification, de quantification, et de séquençage des pathogènes dans les eaux usées. Il/elle assurera le traitement et l'analyse bio-informatique des données de séquençage. Il/elle contribuera également aux travaux de mise en place d’une aquathèque d’eaux usées, dans le cadre de la plateforme d’épidémiologie des eaux usées OBEPINE. Activités : - Développement technique, validation et mise en œuvre de techniques de séquençage, de détection et d’identification de pathogènes dans les eaux usées - Contributions aux travaux sur la stabilité des échantillons d’eaux usées et leur compatibilité avec le séquençage en fonction du mode de stockage. - Contribution à la mise en place d’un système de gestion des métadonnées associées aux échantillons de l’aquathèque. - Mise en place de collecteurs et collecte d’échantillons - Analyse des résultats et coordination des rendus au consortium OBEPINE avec la cheffe de projet. Contexte de travail : Le laboratoire de virologie moléculaire de l’UPR-9002 du CNRS est localisé à l’IUT Louis Pasteur de Schiltigheim. L’ingénieur (F/H) sera placé sous la responsable de thématique « WBE- Wastewater-based epidemiology ». Le groupe WBE compte 5 collaborateurs, dont une étudiante en thèse, une ingénieure d’étude et une technicienne. Le groupe accueille également des stagiaires de master et de BUT. Dans le cadre du projet Obépine le laboratoire collabore avec une dizaine d’autres partenaires en France avec lesquels l’ingénieur•e recruté•e devra interagir, collaborer et communiquer. la personne recrutée bénéficiera des avantages sociaux des personnels CNRS non permanents dont la restauration collective subventionnée, la prise en charge de titres de transports à hauteur de 75% et l'accès aux formations. Conditions particulières d'exercice Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche. Descriptif du profil recherché Competences : - Leadership, communication et management de projets - Maîtrise des techniques de séquençage long read et short read - Analyse bio-informatique de données de séquençage - Maîtrise des techniques de quantification par qPCR et dPCR - Maîtrise des techniques de biochimie et de biologie moléculaire des acides nucléiques - Bonnes pratiques de laboratoire - Autonomie Contraintes et risques : Les travaux avec des eaux usées nécessitent de respecter les bonnes pratiques de laboratoire et le port des équipements de protection individuels (EPI) adaptés. Temps plein Oui Rémunération contractuels (en € brut/an) à partir de 2521€ selon expérience Localisation du poste Europe, France, Grand Est, Bas Rhin (67) Géolocalisation du poste SCHILTIGHEIM Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 67300 SCHILTIGHEIM (France) Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 7 Master/diplômes équivalents Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie) Langues Français (Seuil)