Publiée le 7 juin
Mission du poste
RESPONSABILITÉS : Laboratoire Le poste sera partagé entre l'équipe de Pierre Bost ( https://curie.fr/equipe/bost ) et celle de Manuel Rodrigues ( https://curie.fr/equipe/rodrigues ). L'équipe Bost possède une expertise reconnue dans l'analyse des données biologiques spatiales, en particulier dans le développement de nouvelles méthodes computationnelles pour analyser des données de transcriptomique et de protéomique spatiales. L'équipe Rodrigues est spécialisée en oncologie translationnelle, avec un focus particulier sur la génomique tumorale et les mécanismes de réparation de l'ADN dans le mélanome uvéal. Elle développe des modèles expérimentaux avancés pour étudier les étapes précoces de la tumorigenèse, la dynamique du microenvironnement tumoral et les stratégies de résistance thérapeutique. Le/la postdoctorant(e) interagira avec les deux équipes et bénéficiera d'un encadrement conjoint par les responsables (PI) des deux équipes. Projet de recherche L'objectif de ce projet est de développer de nouvelles méthodes computationnelles pour analyser à grande échelle l'architecture spatiale des tumeurs et déterminer si l'organisation spatiale tumorale peut constituer un biomarqueur prédictif de la survie des patients et de la réponse aux traitements. Comme preuve de concept, le/la postdoctorant(e) travaillera sur des métastases hépatiques de mélanome uvéal, une maladie rare et encore mal comprise, caractérisée par un mauvais pronostic et des options thérapeutiques limitées. Une large collection de données d'histologie, de transcriptomique spatiale et de RNA-seq unicellulaire a été générée par l'équipe Rodrigues. Le/la candidat(e) combinera les données histologiques et de transcriptomique spatiale en utilisant des modèles fondamentaux appliqués à l'histologie afin de développer un réseau de neurones capable de prédire les types cellulaires à partir des seules images histologiques. Ce réseau sera ensuite appliqué à une large cohorte clinique, permettant d'obtenir la distribution spatiale de chaque type cellulaire dans les échantillons. Les outils computationnels développés au sein de l'équipe Bost seront ensuite utilisés pour extraire des caractéristiques spatiales de ces distributions et les exploiter afin de prédire la survie des patients ainsi que leur profil génétique. PROFIL RECHERCHÉ : Formation et compétences Exigences principales • Doctorat (PhD) en analyse d'images, pathologie numérique ou analyse de données. • Expertise pratique en deep learning (TensorFlow ou PyTorch). • Connaissances de base en biologie et en oncologie. • Maîtrise de l'anglais. Atouts supplémentaires • Expertise en histologie et anatomopathologie. • Connaissances en statistiques spatiales, en particulier l'analyse de motifs ponctuels (point pattern analysis). Aptitudes requises · Capacité à travailler dans un environnement hautement interdisciplinaire combinant histologie, oncologie et statistiques spatiales. · Capacité à apprendre rapidement de nouveaux sujets et domaines. Toutes nos opportunités sont ouvertes à des personnes en situation de handicap. Informations sur le contrat Type de contrat : COD Date de démarrage : Septembre 2026 Durée du contrat : 36 mois Temps de travail : Temps complet- forfait jour Rémunération : selon les grilles en vigueur Avantages : Restauration collective, prise en charge du titre de transport annuel à 70%, mutuelle d'entreprise Localisation du poste : Paris Contact Pour postuler, merci d'envoyer CV, lettre de motivation et 2 références Date de parution de l'offre : 01/06/2026 Date limite des candidatures : Dès que pourvu L'Institut Curie est un employeur inclusif respectant l'égalité des chances. Il s'engage également à appliquer des normes exigeantes en matière d'intégrité de la recherche. https://euraxess.ec.europa.eu/sites/default/files/brochures/eur_21620_en-fr.pdf
Profil recherché
Experience: Débutant accepté
Qualification: Cadre
Entreprise
L'Institut Curie est un acteur de la recherche et de la lutte contre le cancer. Il est constitué d'un hôpital et d'un Centre de recherche de plus de 1000 collaborateurs avec une représentativité internationale. L'objectif du Centre de recherche de l'institut Curie est de développer la recherche et d'utiliser les connaissances produites pour améliorer le diagnostic, le pronostic, la thérapeutique des cancers dans le cadre du continuum entre la recherche et l'innovation au service du malade.
