Stage m2 - analyse de l’expression circadienne des gènes du pois - h/f

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France.INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.


Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli(e) au sein del’équipe FILEAS (Seed Filling & Abiotic Stresses in Legumes), appartenant à l’Unité Mixte de Recherche (UMR) Agroécologie basée à Dijon. L’équipe FILEAS mène des recherches pour améliorer et stabiliser la qualité des graines de légumineuses, en particulier le pois et la féverole, pour accélérer les transitions alimentaire et agroécologique. La culture de légumineuses comme le pois (Pisum sativum) offre des avantages multiples, tant d’un point de vue agronomique que nutritionnel et environnemental. Le pois est toutefois sensible aux stress abiotiques (sécheresse, fortes températures), en particulier lors de la floraison et du développement des graines. Dans ce cadre, l’un des objectifs de l’équipe FILEAS est de comprendre les réponses moléculaires du pois à ces stress, et d’identifier des gènes régulateurs des voies de réponse.

Le stage s’inscrit dans le projet ANR CHRONOPEAS (2026-2029), qui vise à utiliser la chronobiologie pour améliorer la résilience du pois aux stress abiotiques. Dans ce projet, nous étudierons l’expression circadienne des gènes, afin de mieux comprendre comment les gènes de réponse aux stress sont régulés au cours de la journée. Au cours de votre stage, vous participerez à l’analyse et à l’interprétation de données de transcriptomique (RNA-Seq) déjà acquises dans l’équipe, obtenues à partir de feuilles et de graines de pois récoltées à différents moments de la journée. Ce travail pourra être poursuivi dans le cadre d’une thèse.

Vous serez plus particulièrement en charge de :

* L’identification du transcriptome rhythmique dans les feuilles et graines de pois, grâce à l’utilisation de packages R existants et de scripts R développés dans l’équipe.
* La comparaison des rythmes d’expression observés entre feuilles et graines de pois.
* L’analyse et l’interprétation biologique des résultats obtenus pour les gènes associés aux réponses aux stress.
* La construction de réseaux de régulation génique, au sein desquels vous identifierez des gènes pouvant jouer un rôle clé dans la réponse de la plante aux stress.

Le stage sera exclusivement réalisé sur ordinateur (analyse, fouille et interprétation de données, bibliographie, rédaction).


Formations et compétences recherchées

Master/Ingénieur (Bac+5)

Formation recommandée: Master 2 (ou équivalent) en Biologie Végétale ou Data Science.

Connaissances souhaitées: Biologie végétale, biologie moléculaire, méthodes d’analyse de données.

Expérience appréciéeen analyse de données avec le logiciel R, en veille bibliographique et en rédaction scientifique.

Aptitudes recherchées: Curiosité scientifique et envie d’apprendre à l’interface biologie/analyse de données, programmation avec le logiciel R (basique ou avancée), attrait pour la visualisation de données, rigueur, sens de l’analyse et de la communication, bonne capacité rédactionnelle, aptitude à travailler en équipe.

Note importante: une expertise complète en biologie ou en analyse de données n’est pas indispensable. Si vous avez un profil plutôt «data analyst» mais souhaitez découvrir la biologie végétale, ou inversement, vous êtes encouragé.e.s à postuler.


Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez(selon le type de contrat et sa durée) :

- jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle
- d'un accompagnement social et prestations : conseil et écoute, aides et prêts sociaux, CESU etc...
- de prestations vacances, loisirs, d'activités sportives, culturelles, familiales : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ; billetterie aux tarifs préférentiels
- d'une restauration collective avec une aire de pique-nique
- de dispositifs de prise en charge partielle par l’employeur des frais de déplacement domicile-travail
- de télétravail autorisé sous conditions définies par la NS en vigueur
- d’un remboursement d'une part des cotisations de protection sociale complémentaire
- de billet congé annuel SNCF
- d’accès facile au Centre INRAE Dijonnais par le tram, le bus + parkings vélos, voitures...
- d’un accueil au sein de l’association dijonnaise FMR² (Fraîchement et Momentanément Recruté·e·s dans la Recherche)


Modalités pour postuler

Transmettre une lettre de motivation et un CV à: M. Titouan Bonnot

Par e-mail: titouan.bonnot@inrae.fr

ou

Par courrier: 17 rue Sully, 21000 Dijon

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publiquenotamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques.> En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr