Cdd exploration des enzymes impliquées dans la propagation des bactériophages à adn modifié h/f

Le projet BEMOD, financé par l'Agence Nationale de la Recherche (ANR), vise à identifier les protéines et à comprendre les mécanismes impliqués dans la propagation des bactériophages à ADN modifié. Certains virus à ADN infectant des hôtes, tels que les protéobactéries, les cyanobactéries et les actinobactéries, présentent une substitution totale de l'adénine par l'aminoadénine (Z), formant ainsi trois liaisons hydrogène dans les paires Z:T. La voie de biosynthèse de l'amino désoxyadénosine triphosphate (dZTP) a été élucidée pour deux bactériophages contenant des génomes ZTGC, et nous avons montré que les ADN polymérases de ces phages discriminent en faveur de l'incorporation de l'aminoadénine et contre celle de l'adénine canonique. Ces bactériophages codent également pour des enzymes modifiant le métabolisme des nucléotides qui favorisent probablement la synthèse de leur génome substitué.

Le premier objectif de ce projet postdoctoral est de rechercher de nouveaux génomes de bactériophages à ADN-Z dans des bases de données métagénomiques afin d'étudier leur distribution environnementale. Nous explorerons ensuite le contenu génique des phages à ADN-Z, en nous concentrant sur les gènes codant pour les enzymes impliquées dans la propagation de l'ADN-Z. Des résultats préliminaires ont identifié différents types d'enzymes impliquées dans la propagation des génomes Z : des enzymes impliquées dans la biosynthèse des nucléotides, les voies de récupération, les enzymes de la machinerie de réplication et les ADN polymérases. Cette partie sera réalisée avec Raphaël Méheust, un expert en génomique comparative. Le second objectif sera de caractériser fonctionnellement les candidats les plus intéressants. Des résultats préliminaires ont révélé des fonctions spécifiques et inattendues de certaines enzymes adaptées aux spécificités de ces bactériophages.