Ingénieur-e en analyse rétrospective des patrons migratoires de l’esturgeon européen

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France.INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.


Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli-e au sein de l’équipe FREEMA (Fonctionnement et Restauration des Ecosystèmes Estuariens et Poissons Migrateurs Amphihalins) de l’unité EABX (Ecosystèmes Aquatiques et changements gloBauX). La mission sera réalisée dans le cadre du projet de recherche STURIO en appui au programme national d’actions en faveur de la restauration de l’esturgeon européen Acipenser sturio.

Chez les esturgeons, une analyse de la composition de multiples éléments chimiques peut être réalisée à partir du rayon de la nageoire pectorale ou des écussons, qui permettent également une estimation de l’âge des individus et donc une reconstruction a posteriori de la composition en éléments chimiques au cours du temps (Bakhshalizadeh et al., 2017), potentiellement équivalente à ce qui peut être réalisé avec les otolithes chez d’autres poissons osseux. Quelques études réalisées sur différentes espèces d’esturgeons mettent en évidence leur pertinence (e.g. Arai et al. 2002; Balazik et al., 2012;Sellheim et al. 2017) afin de reconstruire les trajectoires migratoires des individus à différentes échelles spatiales et temporelles. Dans le cadre du projet REVE (Reconstruction tactiques de Vie Esturgeon européen) (Acolas et al. 2024), un premier travail sur la caractérisation des déplacements des esturgeons européens reconstruit sur la base de l’analyse rétrospectives des structures dures a été mené sur un petit échantillon d’individus capturés en mer (Samson et al., in prep.). Ce travail a notamment permis de valider l’utilisation des rayons pectoraux pour retracer une partie de l’histoire de vie des individus à l’aide de traceurs microchimiques(88Sr, 138Ba and 43Ca) et d’explorer les signatures isotopiques des nageoires (δ15N etδ13C) afin de distinguer les habitats estuariens et marins utilisés par les individus dans les derniers mois. Puis, dans le cadre d’un stage de master 2 (Moine 2025),l’analyse et l’interprétation de ces structures a été élargis en travaillant sur un échantillon d’individus capturés dans l’estuaire de la Girondeafin de retracer leur histoire migratoire de l’eau douce à l’eau saumâtre puis à l’océan.

Dans le cadre de ce travail, il s’agit de poursuivre les analyses réalisées dans la cadre du master 2 (Moine 2025). Vous aurez pour mission de:

* Finaliser l’analyse de données des structures calcifiées à l’aide notamment du package R tempo (ref) et d’analyses statistiques adaptées.
* Participer à la rédaction d’une note de synthèse et de l’article scientifique correspondant.
* Préparer en laboratoire des échantillons destinés à l’analyses des isotopes stables.

Ce travail s’inscrit dans le cadre d’une collaboration entre INRAE et l’IPREM de Pau. Un déplacement peut être envisagé dans ce cadre.

Références citées:

Acolas M.L., M. Lamour, Samson M.2024. Reconstruction des tactiques de vie de l’esturgeon européen Acipenser sturio : focus sur l’utilisation des habitats estuariens et marins par les individus réintroduits en Nouvelle-Aquitaine. Projet REVE, appel à projet ESR 2020 région Nouvelle Aquitaine, agence de l’eau Adour Garonne, rapport INRAE.

Arai T., Levin A.V., Boltunov A.N., Miyazaki N. 2002.Migratory History of the Russian Sturgeon Acipenser Guldenstadti in the Caspian Sea, as Revealed by Pectoral Fin Spine Sr : Ca Ratios. Marine Biology 141, no 2: 315‑19.

Bakhshalizadeh S., Bani A., Abdolmalaki S., Moltschaniwskyj N. 2017.Identifying Major Events in Two Sturgeons’ Life Using Pectoral Fin Spine Ring Structure: Exploring the Use of a Non-Destructive Method. Environmental Science and Pollution Research 24, no 22: 18554‑62.

Balazik M.T., McIninch S.P., Garman G.C., Fine M.L., Smith C.B. 2012. Using energy dispersive x-ray fluorescence microchemistry to infer migratory life history of Atlantic sturgeon. Environ. Biol. Fish 95: 191-194.

Moine C. 2025. Analyse rétrospective des patrons migratoires de l’esturgeon européen. Rapport de stage, Inrae UR EABX, M2 Sciences de la mer, parcours Biologie et écologie marines, université de Bordeaux.

Samson M., Carassou L., Bareille G., Tabouret H., Breton B., Guillou G., Blanchet H., Gazeau-Nadin C., Jatteau P., Acolas M-L.In prep. Migratory tactics of restocked European sturgeon (Acipenser sturio) at the estuarine-marine interface along the French coast, as revealed by multiple biochemical tracers.

Sellheim K., Willmes M., Hobbs J.A, Glessner J.J.G, Jackson Z.J., Merz J.E. 2017.Validating Fin Ray Microchemistry as a Tool to Reconstruct the Migratory History of White Sturgeon.Transactions of the American Fisheries Society 146, no 5: 844‑57.

Travail de bureau, analyses en laboratoire, sorties terrain occasionnelles possible


Formations et compétences recherchées

Master/Ingénieur (Bac+5)

Formation recommandée: Master 2 Sciences de la mer

Connaissances souhaitées:

* Bonne connaissances de l’écologie de l’esturgeon européen.
* Solides compétences pour l’analyse des données microchimiques obtenues par ICPMS sur des rayons pectoraux d’esturgeons.

Expérience appréciée: 6 mois d’expérience sur la thématique

Aptitudes recherchées: Rigueur scientifique, sens critique, esprit de synthèse. Capacité à travailler en autonomie tout en s’intégrant dans une équipe pluridisciplinaire. Aisance dans la rédaction scientifique et technique.


Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez(selon le type de contrat et sa durée) :

- jusqu'à30 jours de congés+ 15 RTTpar an (pour un temps plein)
- d'un soutienà la parentalité : CESUgarded'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences: formation, conseilen orientation professionnelle ;
- d'un accompagnementsocial : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestationsvacancesetloisirs :chèque-vacances,hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activitéssportivesetculturelles ;
- d'unerestaurationcollective ;

-d'une prise en charge partielle abonnement domicile/travail (TER, TBM).


Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publiquenotamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques.> En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr