Chargé d'étude sur l'analyse de données sur le phragmite aquatique h/f

Chargé d'étude sur l'analyse de données sur le phragmite aquatique H/F, Finistere

Contexte du recrutement et définition de poste :

Le Phragmite aquatique, dont les effectifs mondiaux sont en déclin, est un migrateur transsaharien qui niche en Europe de l'Est et hiverne en Afrique de l'Ouest.

Cette espèce bénéficie d'un mémorandum d'entente international (2003) dans le cadre de la CMS, qui a abouti à un plan international d'actions (depuis 2008) piloté par l'Aquatic Warbler Conservation Team. La France, qui accueille une large part des individus lors de leur migration pré et postnuptiale, a une responsabilité particulière pour la conservation de cette espèce. Elle a signé le mémorandum (2010), mis en place un Plan National d'Actions (2010-2014), et l'a renouvelé pour la période 2022-2031.

Le PNA se compose de 3 axes : à l’échelle nationale, internationale et un axe transversal.

L'action 1 concerne le développement d’outils analytiques pour évaluer la fonctionnalité des sites d'escale et leur rôle de halte (engraissement), ainsi que le développement d’indicateurs pour évaluer des actions de restauration et de gestion des habitats favorables au Phragmite aquatique.

Le suivi de la migration par la méthode du baguage est la meilleure technique d'étude de l'espèce durant cette phase de son cycle biologique. Comme de nombreuses autres espèces paludicoles, le Phragmite aquatique bénéficie du suivi de migration par les bagueurs du CRBPO. Depuis 2008, le CRBPO a standardisé un protocole spécifique pour la capture de cette espèce. Ces données doivent être exploitées dans le cadre du PNA pour caractériser les sites.

Pour comprendre les habitats utilisés par l'espèce lors de ses haltes migratoires, des protocoles de suivi par télémétrie ont été réalisés par plusieurs structures en France. Une partie des résultats a permis d'établir une typologie d'habitats. Ces données doivent être ré-exploitées à l’échelle nationale pour affiner cette typologie et développer un outil utilisable sur tous les sites de migration.

Les surfaces d'habitats spécifiques au Phragmite aquatique sont un indicateur indirect de la qualité des sites d'escale migratoire. Ces indicateurs, déjà largement utilisés, doivent être améliorés. L'objectif du PNA est de maintenir ou augmenter ces habitats d'alimentation.

Deux missions principales sont prévues :

1) Proposer des indicateurs locaux d’accueil du Phragmite aquatique (+/- 4 mois)

À partir d’une recherche bibliographique, de l’analyse des données de suivi de migration (PHENO, HALTE, ACROLA) et de données simulées, il s’agira de proposer des indicateurs locaux d’accueil. Ces indicateurs seront intégrés dans un script générant automatiquement un rapport pour chaque station de capture utilisant le protocole ACROLA.

* Préparer le jeu de données et mettre en place une routine
* Valider les éléments analytiques et coder les routines
* Programmer le rapport

2) Affiner la description des habitats favorables (+/- 5 mois)

En utilisant les données de télémétrie sur six sites en Normandie et dans la vallée de l'Adour, et la cartographie associée, l’objectif est d’analyser la sélection des habitats. Il faudra homogénéiser ces cartographies, identifier les habitats préférentiels, et ajuster la typologie d’habitat existante si nécessaire.

* Préparer la base de données
* Harmoniser les couches cartographiques par année et typologie
* Réaliser des analyses spatiales
* Produire et valider une carte par site
* Mettre à disposition les résultats à la communauté de conservation

Conformément à la Convention sur la conservation des espèces migratrices,

Profil recherché :

Compétences :

* Manipulation de données et modélisation statistiques (R)
* Expérience en analyse de données de télémétrie
* Connaissance de la production de rapports avec Rmarkdown (plus)
* Analyses spatiales (QGIS, R-sf)
* Intérêt ou connaissances en ornithologie, migration, phytosociologie/botanique (plus)
* Rigueur, autonomie, sens de l’initiative
* Qualité de rédaction scientifique

Soutiens techniques et scientifiques :

Analyses de données : groupe de travail thématique du PNA (CRBPO, CESCO, PatriNat, CBNB, INRAe)

Rémunération et contrat :

* Poste basé à Brest (29) (négociable)
* Contrat à Durée Déterminée
* Temps complet (35h/semaine, annualisé)
* Durée : 9 mois
* Salaire : groupe E, branche ECLAT
* Prise de poste : dès que possible, selon disponibilités
#J-18808-Ljbffr