Mission :
Le ou La Ingénieur(e) d'Etudes participera au projet CHARMs (ANR) visant à décrypter les mécanismes de répression du VIH-1 par le complexe HUSH (TASOR/MPP8/PPHLN-1), en intégrant expériences de génomique (CUT&Tag, CUT&RUN, DRIP-seq, ATAC-seq) et analyses bioinformatiques. Il ou elle contribuera à la préparation d'échantillons, leur analyse et aux projets en cours dans le groupe de recherche RNA metabolism and HIV latency (https://institutcochin.fr/en/research-project/rna-metabolism-and-hiv-latency).
Activités :
-Culture cellulaire (Jurkat ; HeLa), transfections/électroporations, CRISPR/Cas9 simples (KO/complémentations) et CRISPRi.
-Préparation d'échantillons pour CUT&Tag / CUT&RUN / ATAC-seq, smRNA-FISH/IF, Co-IP, Western-Blot, Nuclear Run On.
*Activités Transversales:
-Communication interne (réunions d'avancement), Gestion des réactifs/anticorps, tenues de cahier, traçabilité.
-Analyse de données & pipelines (Optionnel mais véritable atout):
QC (FastQC/MultiQC), alignements (Bowtie2), filtrages, peak calling (p. ex. HOMER/MACS), intersections (bedtools), matrices & heatmaps (deepTools), tracks bigWig & IGV.
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