Ingénieur développeur - devops (h/f)

Galaxy (galaxyproject.org) est une plateforme ouverte et collaborative qui rend l’analyse bioinformatique accessible, reproductible et transparente. Elle permet d’accéder à des outils de bioinformatique, initialement prévus pour la ligne de commande ou le scripting, via une interface web conviviale, sans prérequis en langage de programmation ou ligne de commande. UseGalaxy.fr est l’instance nationale de Galaxy en France (3500 utilisateurs actifs, 6M de jobs), opérée par l’Institut Français de Bioinformatique (IFB, www.ifb-elixir.fr). Il s’agit d’une ressource centrale, qui a vocation à rassembler différentes instances thématiques ou locales. Ainsi, cette initiative permet de fédérer les efforts sur la maintenance et le support. UseGalaxy.fr est géré de manière collaborative et ouverte via un ensemble de dépôts GitLab et l’usage de robots d’Intégration Continue (CI) (Gitlab CI, Ansible).
L’Institut Français de Bioinformatique (IFB; france-bioinformatique.fr) est une infrastructure nationale qui regroupe 28 plateformes régionales de bioinformatique et une unité coordinatrice, IFB-Core (UAR3601). GenOuest est une des plateformes membres de l’IFB, contribuant notamment au pilotage du projet UseGalaxy.fr.
Dans le cadre du programme de recherche “Bioproductions (B-BEST)” (projet ciblé “Galaxy-BioProd”), GenOuest recrute un ingénieur développeur - DevOps (H/F). La personne recrutée aura pour principale mission de contribuer au développement, à l’évolution, au déploiement et au maintien en condition opérationnelle de UseGalaxy.fr. Elle sera aussi en contact avec les utilisateurs finaux pour leur apporter solutions et assistances (helpdesk). Enfin, elle prendra part aux initiatives de collaboration à l’échelle européenne autour de la Communauté Galaxy ELIXIR (ex: contribution au réseau européen de calcul Pulsar, participer à la communauté UseGalaxy.*, ...).


Activités

Activités principales
- Piloter ou participer à l’évolution de l’instance : mise à jour, évaluation et implémentation des nouvelles fonctionnalités …
- Administrer de l’instance usegalaxy.fr : installation d’outils, banques, gestion des quotas, débogage ...
- Assurer une veille technologique.
- Participer aux initiatives européennes et internationales autour du projet Galaxy
- Participer ou prendre en charge aux portages d’outils (wrapping) sous Galaxy
- Participer ou prendre à la création de packages Conda:

Activités associées :
- Présenter ses activités : webinars, réunions de travail en visio et en présentiel.
- Participer à l’assistance et au support utilisateur.
- Participer à l’organisation et à la réalisation de formations à l’utilisation des solutions mises en place


Compétences

- Maîtrise du langage Python en environnement Linux
- Maîtrise des outils et technologies WEB (NGINX, Apache, etc.).
- Maîtrise des technologies web (JavaScript, API REST)
- Connaissance et pratique de l'intégration continue, la distribution continue et le déploiement continu
- Connaissances des outils et technologies associées (GitLab CI, Docker, Ansible).
- Connaissances de base en systèmes de calcul HPC (Slurm, …)
- Bonne connaissance des solutions de conteneurisation et de gestion d’infrastructures pour applications conteneurisées.
- Bonne connaissance des environnements Linux (Ubuntu…).
- Notions générales en architecture système et réseau .
- Sensibilisé-e à la sécurité informatique
- Langue anglaise : B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues)
- Savoir rédiger des documentations
- Capacité à travailler en mode projet et en équipe.
- Capacité à travailler à distance au sein d’une équipe distribuée.
- Réactivité, autonomie, initiative, rigueur.
- Gérer les situations d'urgence et hiérarchiser les priorités.
- Esprit d’équipe et sens de la collaboration.
- Capacité d’écoute et sens du contact.
- Capacité à apprendre et se former en continu dans un contexte scientifique en évolution rapide.
- Rigueur scientifique, aptitudes organisationnelles.
- Aptitudes relationnelles et goût pour le travail en équipe


Contexte de travail

Le poste est rattaché à la plate-forme GenOuest, au sein du laboratoire de recherche informatique IRISA à Rennes. La plate-forme GenOuest est membre de l’Institut Français de Bioinformatique. Implantée dans la communauté bioinformatique depuis plus de 20 ans, GenOuest offre ses services à une large communauté de plus de 850 scientifiques et porte de nombreux projets de développements se focalisant sur le calcul, la reproductibilité des traitements et la gestion des données scientifiques.
L'ingénieur développeur travaillera en étroite collaboration avec les ingénieurs de la plateforme, de l’IFB, et les partenaires du projet ciblé Galaxy-Bioprod (PEPR B-BEST).

Le poste proposé se situe sur le campus de Beaulieu à Rennes. Des déplacements occasionnels en France et à l’étranger sont à prévoir.

Présentation du CNRS en tant qu'employeur : https://www.cnrs.fr/fr/le-cnrs
L'IRISA comme laboratoire d'affectation : https://www.irisa.fr/umr-6074

Poste à temps plein, 38h30 hebdomadaires avec RTT.
Possibilité de télétravail.

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.

Le poste est rattaché à la plate-forme GenOuest, au sein du laboratoire de recherche informatique IRISA à Rennes. La plate-forme GenOuest est membre de l’Institut Français de Bioinformatique. Implantée dans la communauté bioinformatique depuis plus de 20 ans, GenOuest offre ses services à une large communauté de plus de 850 scientifiques et porte de nombreux projets de développements se focalisant sur le calcul, la reproductibilité des traitements et la gestion des données scientifiques.
L'ingénieur développeur travaillera en étroite collaboration avec les ingénieurs de la plateforme, de l’IFB, et les partenaires du projet ciblé Galaxy-Bioprod (PEPR B-BEST).

Le poste proposé se situe sur le campus de Beaulieu à Rennes. Des déplacements occasionnels en France et à l’étranger sont à prévoir.

Présentation du CNRS en tant qu'employeur : https://www.cnrs.fr/fr/le-cnrs
L'IRISA comme laboratoire d'affectation : https://www.irisa.fr/umr-6074

Poste à temps plein, 38h30 hebdomadaires avec RTT.
Possibilité de télétravail.

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.