Ingénieur-e d'étude en bioinformatique

Informations générales Organisme de rattachement Nantes Université Référence 2026-2227838 Date de début de diffusion 19/03/2026 Date de parution 19/03/2026 Date de fin de diffusion 19/04/2026 Localisation Nantes Intitulé long de l'offre Ingénieur-e d'étude en bioinformatique Date limite de candidature 18/04/2026 Nature du contrat CDD de 2 ans Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Experte / Expert en production, traitement et analyse de données Statut du poste Vacant Intitulé du poste Ingénieur-e d'étude en bioinformatique Descriptif de l'employeur Nantes Université est un établissement public d’enseignement supérieur et de recherche qui propose un modèle d’université inédit en France unissant une université, un hôpital universitaire (CHU de Nantes), un institut de recherche technologique (IRT Jules Verne), un organisme national de recherche (Inserm) ainsi que Centrale Nantes, l’école des Beaux-Arts Nantes Saint-Nazaire et l’École Nationale Supérieure d’Architecture de Nantes. Ces acteurs concentrent leurs forces pour développer l’excellence de la recherche nantaise et offrir de nouvelles opportunités de formations, dans tous les domaines de la connaissance. Durable et ouverte sur le monde, Nantes Université veille à la qualité des conditions d'études et de travail offertes à ses étudiantes, étudiants et personnels, pour favoriser leur épanouissement sur tous ses campus de Nantes, Saint-Nazaire et La Roche-sur-Yon. Descriptif du service Le CR2TI est une Unité Mixte de Recherche de l’Inserm et de Nantes Université basée sur le campus du CHU de Nantes et le bâtiment IRS2. Il est constitué de 6 équipes de recherche pour un total de 230 personnes (chercheurs, enseignants-chercheurs, cliniciens, étudiants, ingénieurs, techniciens) principalement dédiées au décryptage des mécanismes immunologiques et à l'amélioration du diagnostic et des traitements dans les domaines de la transplantation d’organes, des maladies inflammatoires, auto-immunes et des maladies infectieuses. Description du poste Le projet du poste proposé s'inscrit dans un programme de recherche international, multicentrique ANR NeoTraid (Neonatal Treg in autoimmune diseases), coordonné par le Dr Cédric Auffray à l'Institut Cochin, Paris, en collaboration avec le Dr Benoit Salomon (Infinity, Toulouse) et le Dr Matthieu Giraud (CR2TI, Nantes). L'objectif général de ce projet est d'étudier l'impact des lymphocytes T régulateurs néonataux (nnTregs) dans le contrôle des maladies auto-immunes chez la souris, en portant une attention particulière au rôle du facteur de transcription Foxo1 dans leur génération et aux moyens de moduler les nnTreg par des micro-organismes. Le/la bioinformaticien-ne recruté-e travaillera spécifiquement sur la dissection des programmes transcriptionnels et épigénétiques contrôlés par Foxo1 dans le développement des lymphocytes T régulateurs thymiques (tTregs). Activités principales · Activité 1 : Analyse de données transcriptomiques et épigénétiques · Activité 2 : Analyses bio-informatiques avancées · Activité 3 : Valorisation et collaboration RETROUVEZ LA FICHE DE POSTE EN INTEGRALITE : https://www.univ-nantes.fr/universite/recrutement/nantes-universite-recrute-un-e-ingenieur-e-detude-en-bioinformatique-cr2ti Conditions particulières d'exercice Environnement de travail : · Bureau partagé · Travail en équipe Rythme de travail : · Horaires fixes Conditions de travail : · Usage d’un écran Descriptif du profil recherché • Formation et/ou qualification : Master 2 en Bioinformatique ou Doctorat en Bioinformatique / Biologie computationnelle • Expériences requises en analyse de données transcriptomiques (RNA-seq, scRNA-seq) et en analyse de données épigénétiques (ATAC-seq, ChIP-seq) • Expériences antérieures bienvenues pour occuper le poste : minimum 2 ans d’expérience sur des projets en immunologie Temps plein Oui Rémunération contractuels (en € brut/an) 23,5k à 36,6k brut/annuel Informations complémentaires Télétravail possible Oui Localisation du poste Europe, France, Pays de La Loire, Loire Atlantique (44) Géolocalisation du poste 1, quai de Tourville 44035 Nantes Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 30 bd Jean Monnet 44000 Nantes Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 7 Master/diplômes équivalents Niveau d'expérience min. requis Confirmé Compétences attendues Savoirs généraux, théoriques ou disciplinaires : • Excellente maîtrise de R et des packages Bioconductor • Expérience avec les pipelines d'analyse single-cell (ArchR, Seurat, Monocle3) • Maîtrise de l'environnement Linux/Unix • Connaissance des outils d'analyse de données NGS Savoir-faire opérationnels : • Expérience en immunologie computationnelle • Connaissance des méthodes d'intégration multi-omiques • Expérience avec les outils de visualisation (ggplot2, ComplexHeatmap) • Pratique de Python • Expérience de publication dans le domaine Savoir-être : Capacité à travailler en équipe et en collaboration avec plusieurs partenaires • Autonomie et rigueur scientifique • Bonnes capacités de communication et de présentation • Anglais scientifique lu, écrit et parlé Documents à transmettre L'envoi du CV et d'une lettre de motivation est obligatoire Date de vacance de l'emploi 01/05/2026 Mail à qui adresser les candidatures (bouton postuler) recrutement-polesante-150409@emploi.beetween.com Contact 1 Dr Matthieu Giraud – matthieu.giraud@univ-nantes.fr