Assistant ingénieur en virologie et génomique cliniques

Informations générales Organisme de rattachement ENVT Référence 2026-2199225 Date de début de diffusion 19/02/2026 Date de parution 19/02/2026 Localisation Toulouse Intitulé long de l'offre Assistant ingénieur en virologie et génomique cliniques (H/F) Date limite de candidature 18/02/2026 Employeur L'Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT) est un établissement public d'enseignement supérieur et de recherche sous tutelle du Ministère de l'Agriculture et de la Souveraineté Alimentaire (MASA Nature du contrat CDD d'1 an Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Experte / Expert en biologie - SVT Statut du poste Susceptible d'être vacant Intitulé du poste Assistant ingénieur en virologie et génomique cliniques Descriptif de l'employeur L’Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT) est un établissement public d’enseignement supérieur et de recherche sous tutelle du Ministère de l’Agriculture et de la Souveraineté Alimentaire (MASA) (www.envt.fr). L’Etablissement a pour mission première la formation des vétérinaires (160 diplômés par an) dans le cadre d’un référentiel de formation national qu’il se doit de respecter. L’Ecole est accréditée par l’Association Européenne des Etablissements Vétérinaires (AEEEV) et donc soumise au respect des normes de cette association. Les équipes d’enseignants sont regroupées au sein de trois départements : - Elevage et produits/Santé publique vétérinaire, - Sciences biologiques et fonctionnelles, - Sciences cliniques des animaux de compagnie, de sport et de loisirs. En matière de recherche, l’Etablissement accueille plusieurs équipes de scientifiques (la plupart sont des UMR avec une cotutelle INRAe, INSERM, UPS, …) en lien avec la santé animale, l’hygiène des aliments ou la génétique. L’UMR ENVT-INRAE IHAP (Interactions Hôtes Agents Pathogènes) est un laboratoire pluridisciplinaire qui conduit des recherches sur les maladies infectieuses animales d’importance prioritaire pour la santé de l’animal et la santé publique, dans une approche « une seule santé ». Cette unité couvre différents types d’agents pathogènes (virus, bactéries, parasites), d’hôtes (ruminants, volailles, modèles rongeurs, faune sauvage, …) et d’échelles. Descriptif du service La demande de poste d’assistant ingénieur (H/F) s’inscrit dans le contexte du développement très important des projets de recherche en virologie clinique. Cette activité couvre un large champ technique : biologie moléculaire, culture virale, sérologie, séquençage et appui à l’histopathologie moléculaire (technologie d’hybridation in situ et extraction d’acides nucléique à partir d’échantillons fixés et paraffinés). Dans ce contexte, les objectifs du poste consistent, au sein de l’équipe VIRAL de l’UMR IHAP, à prendre en charge des essais de diagnostic et de recherche en virologie clinique. Description du poste Mission 1 : virologie clinique (diagnostic et recherche) : biologie moléculaire et sérologie Réceptionner, enregistrer et stocker les échantillons selon un protocole de qualité défini, Tenir un cahier d’expériences, rassembler les résultats, les mettre en forme et en rendre compte. Réaliser, à partir de protocoles définis, des expériences de préparation et d’analyse utilisant un ensemble de techniques, notamment en biologie moléculaire (PCR conventionnelle, PCR temps réel, PCR digitale) et en sérologie (ELISA essentiellement, IHA ou séroneutralisation). Actualiser le dossier de protocoles techniques. Missions 2 : métagénomique clinique Participer à la mise au point et mettre en œuvre les méthodes spécifiques de préparation des acides nucléiques en vue du séquençage NGS (technologie Oxford Nanopore notamment) Préparer des banques de séquençage NGS, lancement des essais (« runs ») de séquençage. Sauvegarder des données de séquençage NGS Mission 3 : missions transversales d’appui à l’activité du laboratoire de virologie clinique Contribuer à la surveillance des équipements scientifiques, la maintenance de premier niveau et l’entretien du laboratoire Se former à la mise en œuvre des nouvelles techniques dans le service et initier/accompagner les utilisateurs Appliquer, en situation de travail, les bonnes pratiques de laboratoire, les règles d’hygiène et de sécurité et celles spécifiques à la manipulation de certains produits Participer à la gestion des stocks et des commandes Contraintes d’hygiène et sécurité relatives au travail en L2 et L3. Travail prolongé sous poste de sécurité microbiologique. Station debout et/ou assise prolongée. L’activité de l’agent s’exercera sous la responsabilité de l’ingénieur de recherche qui pilote le plateau de virologie et génomique de l’unité IHAP (équipe VIRAL), sous l’autorité du Directeur de l’Unité IHAP. Il/elle interagira au quotidien avec les chercheurs, doctorants de l’équipe VIRAL et d’autres équipes de l’UMR IHAP. L’agent interagira également avec les services support de l’ENVT (administratifs, techniques et informatiques) et les interlocuteurs externes du laboratoire. Descriptif du profil recherché Savoirs Connaitre les techniques de biologie moléculaire de base Bonnes pratiques de laboratoire Savoir appréhender les risques chimiques et biologiques liés aux produits, matériels et techniques utilisées. Savoir utiliser les logiciels liés aux techniques expérimentales et à la présentation des résultats. Comprendre une documentation en anglais Des notions de NGS, de métagénomique et de sérologie seraient appréciées. Savoir-faire Organiser et conduire son activité avec rigueur, autonomie et fiabilité Savoir manipuler dans des conditions stériles et travailler en milieu confiné Savoir utiliser les équipements de base d’un laboratoire (thermocycleur, microscope, centrifugeuse, spectrophotomètre, balance, …) Communiquer et collaborer avec les autres parties prenantes d’un projet. Savoir rendre compte, travailler en équipe Savoir transférer ses connaissances pour l’accompagnement à l’utilisation d’outils Temps plein Oui Rémunération contractuels (en € brut/an) 1900 à 2200€/mois Informations complémentaires Informations complémentaires Diplômes réglementaires minimum requis : niveau 5 (anciennement III) ou équivalence sur la base de la valorisation de l’expérience professionnelle. Rémunération : de 1900 € à 2200 € bruts mensuels selon expérience Contrat : de 12 ou 24 mois à confirmer Localisation du poste Europe, France, Occitanie, Haute Garonne (31) Géolocalisation du poste 23 chemin des Capelles, BP 87614 31076 Toulouse Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 23, Chemin des Capelles - 31300 Toulouse Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 5 Diplômes de niveau bac 2 Spécialisation Physique-chimie Chimie-biologie, biochimie Sciences naturelles (biologie-géologie) Niveau d'expérience min. requis Expert Documents à transmettre L'envoi du CV est obligatoire Date de vacance de l'emploi 01/04/2026 Mail à qui adresser les candidatures (bouton postuler) job-ref-oj26325kfm5ht@emploi.beetween.com